Успешное ветеринарное обеспечение Советской Армии и Военно-Морского Флота в Великой Отечественной войне подтвердило правильность разработанных в довоенное время организационной структуры и принципов работы военно-ветеринарной службы, которые в ходе военных действий были лишь в некоторой степени уточнены и дополнены. Опыт войны показал важность ветеринарно-санитарного контроля за обеспечением войск продовольствием. Осуществление этих мероприятий и сохранение эпизоотического благополучия Советских Вооруженных Сил на всем протяжении войны способствовали поддержанию эпидемического благополучия войск и сил флота. Опыт Великой Отечественной войны опроверг взгляды ряда буржуазных ученых на эпизоотию как на непременный спутник всех войн, разрастающийся в военное время и нередко превращающийся в национальное бедствие.
В годы Великой Отечественной войны получили дальнейшее развитие принципы и методы управления Тылом Вооруженных Сил. Они складывались и совершенствовались вместе с принципами и методами управления войсками и силами флота как их составные части. Важнейшими принципами управления Тылом Советской Армии и Военно-Морского Флота в ходе войны являлись: партийность, единоначалие, централизация, научность и предвидение.
Принцип партийности в управлении тылом вытекал из классового характера войны, руководящей роли Коммунистической партии в военном деле и решающего значения морально-политического состояния личного состава для выполнения стоящих перед ним задач. Применение этого принципа в Тылу Вооруженных Сил в ходе войны заключалось в строгом и точном выполнении требований ЦК партии по всем вопросам, связанным с тыловым обеспечением войск и сил флота. Проведение политики Коммунистической партии среди личного состава Тыла Вооруженных Сил, воспитание у него высоких морально-политических, боевых и деловых качеств достигались активной политической и организаторской работой командования, политических органов и органов управления тылом, командиров (начальников) и политических работников всех тыловых соединений, частей и учреждений.
Великая Отечественная война со всей очевидностью подтвердила правильность линии Коммунистической партии на осуществление в Тылу Вооруженных Сил принципа единоначалия. Сущность его как принципа управления тылом заключалась в единоличной ответственности командующих и командиров всех степеней за все стороны жизни и деятельности подчиненных войск (сил), в том числе и за их тыловое обеспечение. От начала и до конца войны при подготовке и в ходе операций организация тылового обеспечения являлась неотъемлемой, важнейшей областью работы всех командующих и командиров по руководству войсками (силами). Единоначалие командующих и командиров сочеталось с инициативой их заместителей по тылу, начальников штабов тыла, начальников родов войск, специальных войск и служб, а также всех офицеров органов управления тылом при выполнении ими решений единоначальников. Последние принимали решения только по важнейшим вопросам организации тылового обеспечения. Их заместители по тылу, начальники штабов тыла, родов войск, специальных войск и служб на основе прав, предоставленных им законами и регламентируемых уставами и приказами вышестоящих начальников, в пределах своих функций и полученных задач непосредственно решали все конкретные вопросы организации тылового обеспечения войск (сил).
Огромную роль в успешном выполнении большого комплекса сложных задач тылового обеспечения Вооруженных Сил в ходе войны сыграло осуществление принципа централизации управления тылом. Этот принцип проводился в жизнь по двум направлениям.
Первое направление выражалось в объединении командованием и органами управления тылом вышестоящей инстанции деятельности не только непосредственно подчиненных, но и всех нижестоящих тыловых соединений, частей, учреждений и органов управления тылом, в сосредоточении по единому плану их усилий в целях полного и бесперебойного тылового обеспечения войск (сил). Такую централизацию руководства тыловым обеспечением Вооруженных Сил В. И. Ленин считал непременным условием победы. Еще в годы гражданской войны в «Проекте директивы ЦК о военном единстве» он рекомендовал «признать безусловно необходимым на все время социалистической оборонительной войны объединение всего дела снабжения Красной Армии под единым руководством Совета Обороны и других центральных учреждений РСФСР»660
.