В дальнейшем Волжская флотилия поддерживала наступление войск Восточного фронта, обеспечивала переправы войск через Каму и с переменным успехом вела бои с флотилией белых. Причем, после нескольких боев обе флотилии действовали уже «бесконтактно», фактически не мешая друг другу выполнять задачи по поддержке собственных сухопутных войск. Как правило, красные высаживали десанты для захвата городов на берегу реки, поддерживая их огнем. Поэтому, в кампанию 1919 года на Волге, десантные отряды из вспомогательных сил стали основными. В 1919 году десантный отряд флотилии, под командой И.К.Кожанова, участвовал во взятии в мае Сарапула и Елабуги, в форсировании реки Вятки, а затем был переброшен под Царицын. По мере отхода белых войск на восток ареал действия Камской белой флотилии сужался, пока она не самозатопилась в реке Чусовой.
В июле-августе 1919 года отряд матросов флотилии, во главе с комиссаром Зубковым, осуществлял охрану судоходства на Каме в районе Сарапула, а с 15 августа принимал участие в карательной операции против восставших ижевских рабочих. В июле 1919 года подняло восстание против Советской власти население Вольска и крестьяне окрестных деревень. Здесь так же не обошлось без матросов-карателей. Из личного состава флотилии наскоро создали несколько боевых групп, которые были брошены в город. Для подавления восстания были задействованы и вооруженные суда флотилии. Через две недели напряженных боев восстание в Вольске удалось подавить.
После поражения и отступления армии адмирала Колчака, бои на Волге продолжились уже под Царицыным. К этому времени матросы там уже успели оказать помощь во время обороны города в 1918 году. Вторично Царицын пришлось оборонять уже от войск генерала П. Врангеля в июне 1919 года. При этом суда флотилии регулярно обстреливали позиции белых войск. В конце августа под Камышином произошел ряд перестрелок с батареями белых. При обороне Царицына отличились и десантники отряда И.К. Кожанова, которые участвовали в нескольких неудачных штурмах, захваченного белыми Царицына.
Так, при очередном штурме Царицына, в районе французского завода погибло более 400 кожановцев. Отряд был фактически разбит и бежал. Отставших и раненых белые рубили шашками. Немногие уцелевшие переправлялись через Волгу на плотах и лодках. При этом по беглецам с Мамаева курган била белая артиллерия. Но случались и удачи. Так весьма удачным был десант отряда И.К. Кожанова у села Ганюшкина, когда, в результате неожиданного удара, было захвачено более тысячи пленных.
Из воспоминаний матроса-кожановца С.К. Белова: «В ноябре 1919 года после боев за Царицын и отдыха, десантный отряд принимал участие в подавлении крестьянских восстаний, поддержанных белоказаками, на реке Бузан (притоке Волги) в селе Ганюшкино и Красный Яр, Конный Магой и Ново-Красное, Марфино, Сафоновка, Дамба».
Кожановцы, как правило, ходили в матросских бушлатах с распахнутой грудью. Были, нарочито решительны и порывисты в движениях и делах. В бой рвались неукротимо. Это тоже была особая матросская десантная традиция.
Бывший начальник разведки десантного отряда В.С. Милютин так описывал атаку десантников Кожанова под Елабугой: «Моряки шли в атаку в полный рост. Они не имели вообще обыкновения стрелять с колена или лежа. Многие падали убитыми и раненными». Он же, с явным негодованием, пишет, что в боях с деникинцами под Царицыным, матросам все же пришлось рыть окопы и укрываться в траве…
Из-за огромных потерь отряд И.К. Кожанова все время пополнялся новыми матросами. Несмотря на большие потери моральная обстановка в отряде была хорошая. Железная матросская спайка связывала и рядовых, и командиров. В отряде не существовало иного обращения друг к другу, как «братишка» или «браток». Можно было слышать, когда подчиненные обращались к командирам, называя их по именам «Ваня, Яша», Вася», но это вовсе не означало панибратства. Любое приказание командира выполнялось в кожановцами беспрекословно. Правилом было и то, что И.К. Кожанов безжалостно расстреливал мародеров. Матрос десантного отряда В.С. Милютин в своих воспоминаниях приводит такой случай. Один из матросов украл несколько гусей, которых с корешами сварил и съел. Хозяйка пожаловалась. Матроса опознали, и Кожанов приказал его расстрелять. Однако хозяйка вступилась за несчастного. В конце концов, виновному было приказано уплатить за каждого из съеденных гусей по 200 рублей (при цене гуся в 5 рублей). Впрочем, думается, матрос переплатил за гусей с превеликой радостью.
Дерзость и апломб кожановцев не нравились матросам судовых команд флотилии, поэтому дружбы между «корабельными» и «десантными» не было. Из воспоминаний бывшего матроса десантного отряда И.В. Чистова: «Непонимание между десантом и судовой командой. Так кочегары воровали мясо из общего котла, и десанту приходилось довольствоваться пустым бульоном».