Большие опасения вызвало появление Мадары Учиха, на этот раз настоящего. Мадара вернулся многократно более сильным, он владел Мокутоном и у него был Риннеган. Он успешно противостоял совокупной мощи армии, использовал безумно сильные техники Риннегана и даже однажды чуть не уничтожил штаб Альянса (Нагато едва удалось изменить траекторию огромного метеора, грозящего его уничтожить). Единственным положительным моментом появления древнего монстра было то, что Курама, ненавидевший Мадару более всего на свете, перестал дуться на Наруто и позволил воспользоваться своей чакрой во всей полноте. Это решило судьбу схватки. По просьбе сына, отец запечатал в него вторую половину Курамы и, пылая золотой чакрой покрова биджу, Наруто обрушил на Учиху всё, что когда-либо знал и умел, всё, чему обучился за эти годы у друзей, врагов, союзников и учителей. У Мадары не было шансов — сенпо-разенсюрикены всех пяти стихий, запущенные одновременно руками чакры покрытого чёрными узорами золотого гиганта, были слишком разрушительны, чтобы их смог выдержать даже Сусаноо легендарного Учиха. Ну а пока тело мертвеца собиралось из пепла, его успели облепить печати Конан-чан.
Всё прекратилось как-то единомоментно и неожиданно. Воскресших шиноби врага окутали столбы света, и они развеялись пеплом, оставив за собой тела принесённых жертв. И пока армия перегруппировывалась, ожидая новых сюрпризов, появился ослепший на один глаз Итачи с Кабуто Якуши через плечо. Кабуто не был прежним, теперь он выглядел странной смесью человека и змеи, правда не дотягивал до истинной формы Орочимару по омерзительности.
С исчезновением призванных мертвецов и истреблением Зецу, тела которых были признаны ценным медицинским материалом и реквизированы Цунаде, Четвёртая Мировая Война Шиноби была завершена. Предстояли долгие годы последствий: выполнение заключённых договоренностей, новые политические ходы, выяснение отношений между деревнями, отложенное ранее на период военного времени. С появлением настоящего Мадары все сомнения насчёт Мануке исчезли, и, по мнению Наруто, без силы легендарного имени его слишком уж стали недооценивать, посчитав ещё одним нукенином S-ранга, которых Великие Нации повидали предостаточно. Наруто не верил, что все закончилось. Человек, плетущий паутину интриг столько лет подряд, не мог сдаться и прекратить, в его распоряжении была чакра семи биджу и Глаза Мудреца. Узумаки не понимал, почему тот скрылся, ведь с подобными силами он мог бы доставить Альянсу массу неприятностей и его шансы на победу пусть и не были высокими, но не были и нулевыми. Не могло же это быть связано с ударом Наруто, напрочь проигнорировавшим нематериальность Шарингана!
К сожалению, отец тоже посчитал, что угроза миру устранена. Наруто досадовал, что слишком поздно они вспомнили о фуин-шики, размещенной отцом на руке человека в маске в день рождения Наруто, в день, когда Кьюби едва не уничтожил деревню. Папа увидел, что Коноха в безопасности, что его сын стал сильным шиноби, что он не только вынес возложенную на него ношу, но и превзошёл все самые смелые надежды. Тяжкий груз вины, лежавший на душе из-за гибели любимой женщины больше его не угнетал, поэтому после слов прощания папу окутал столб света и он вернулся в Чистый Мир, оставив за собой лишь облако пепла и тело Зецу, мгновенно поросшее зелёными ветвями.
На душе Наруто было неспокойно. Мануке что-то задумал, и это тревожило его каждую секунду. Он не прекращал отсылать во все стороны клонов, обшаривающих сенсорными дзюцу каждый уголок мира, досадуя, что маркер Хирайшина может использовать только создатель, и каждому пользователю техники необходимо разрабатывать свою фуин-шики. И когда уже показалось, что поиски ни к чему не приведут, что Мануке скрылся в своём измерении, клоны почувствовали аномально огромный источник природной энергии.
Что бы ни делал подонок, это требовало уединения — иначе для чего было забираться в такую даль? Сотни километров на другой стороне континента означали, что шиноби Альянса потребуется пара часов, чтобы добраться до нужной точки, и первыми туда доберутся те, кто владеет дзюцу полёта. По странному совпадению, из всех каге, мёртвых и живых, подобным обладал только дедуля Ооноки. И, несмотря на возраст, заставляющий Сарутоби Хирузена казаться мальчишкой, Цучикаге вырвался далеко вперёд. За ним следовали внучка Куроцучи, Конан-чан на бумажных крыльях, Саске, летящий в расправившем крылья Сусаноо, и Наруто в покрове биджу. Самые быстрые шиноби устремились за ними по земле, но безнадёжно отставали. Ветер ревел в невидимых крыльях Наруто, стихия толкала его вперёд, к источнику новой опасности. Чувство неизбежной беды окутало душу и Узумаки прилагал всё больше и больше усилий, чтобы лететь быстрее, чтобы вовремя успеть.
Но он опоздал.