Черногорские принцессы, когда Распутин оказался во дворце, намеревались использовать его далее в своих собственных целях. Но не тут-то было, Григорий не поддался. Не уступил он другим, а возле него кто только не крутился: и правые, и левые, и масоны. Он не хотел быть зависимым, предпочитая радеть о своих интересах и сохранять свободу воли. А еще он надеялся на надежное покровительство и защиту царя и тут ошибался, поскольку государь вынужден был прислушиваться к мнению двора, света и своих подданных. Лишние скандалы царской семье были вовсе не нужны.
Этим соображением вполне может объясняться завеса таинственности вокруг обстоятельств и даты знакомства Распутина и царя. Что делать мужику во дворце? Зачем он там? Поэтому по официальной версии считается, что он приходит во дворец к няньке царских детей — Марии Вишняковой (позднее она обвинит Григория в изнасиловании). Посещения такого рода по регламенту не фиксируются в камер-фурьерском журнале, в отличие от информации обо всех визитах к царю и царице. Распутин, однако, попадает в хваткие ручки умной и предприимчивой Анны Вырубовой, и тогда разобиженные черногорские сестры объединяются против Распутина с великим князем Николаем Николаевичем, на дух не выносившим любых юродивых и старцев, и выступают единым фронтом. Григорий получает требуемые на постройку храма в родном селе деньги и покидает столицу. Вернее сказать, его выпроваживают, чтобы не мозолил глаза.
Григорий возвращается на родину, собирая вокруг себя все увеличивающееся число поклонников. Он возвращается не один, а со странницами и дает им приют в своем доме. Считается, что они живут у него в работницах, во всяком случае, так объясняет сам Распутин. Разумеется, в те времена в сибирском селе такое выглядело не вполне нормальным. Как это так, что под одной крышей с женатым мужиком живут еще какие-то женщины?
Сельские священники сначала просто неодобрительно косились, а потом отправили донос в Тобольскую консисторию, в котором сообщали о предосудительном поведении Григория Распутина. В письме говорилось, что он неподобающим образом ведет себя с женщинами, они к нему приезжают даже из самого Петербурга. Подолгу живут у него в доме — это при живой-то жене! Григорий водит их в баню и там якобы избавляет от страстей. «Женщины, окружавшие его, относились к нему с мистическим обожанием, называли «отцом», целовали руку». Сообщалось так же о молениях и песнопениях в конюшне.
Григорий почувствовал неладное и хотел развернуть ситуацию в свою пользу, предложив на сельском сходе пять тысяч рублей на постройку храма, но делу уже дали ход, так что с предложением он несколько опоздал. 6 сентября 1907 года было инициировано «Дело Тобольской консистории по обвинению крестьянина слободы Покровской Тюменского уезда Григория Ефимовича Распутина-Новаго в распространении им лжеучения, подобно хлыстовскому, и образованию последователей своего учения».
Фамилией Новый, или Новых, Григорий обязан самому государю: Николай II лично просил Бенкендорфа поторопиться с бюрократической процедурой изменения фамилии для своего «крестника». Царь, наделив Распутина новой фамилией, становится действительно его «крестным отцом», а позже он разделит судьбу Григория и тоже погибнет от выстрела…
В ходе следствия Григорию ставили в вину и ночные моления в конюшне, и баню вместе с женщинами, и много чего другого. Трудно понять, где была правда, а где вымысел. Примечательно, однако, что все свидетели старательно выгораживали Распутина, ну, и себя по пути обеляли. Односельчане, не желая связываться с полицией, давали показания в нейтральном ключе: не знаем, не видели, не слышали, молятся, ничего дурного не замечали.
В этом деле по обвинению Распутина в хлыстовстве множество темных деталей, разобраться в которых до конца, тем более сейчас, через много лет, не представляется возможным. Но приходится признать, что основания были — многое в его поведении, в обрядовой составляющей соотносится с хлыстовскими привычками и обрядами.
Следствие приходит к выводу о виновности Григория Ефимовича Распутина, и новость о хлыстовстве Распутина, распространенная стараниями газетчиков, становится достоянием всей России. Но тут случается неожиданный поворот: новый Тобольский епископ санкционирует дополнительное расследование, берет его ход под личный контроль, а затем отправляет в консисторию такое заключение: «Из всего вышеуказанного преосвященный Алексий вынес впечатление, что дело о принадлежности крестьянина Григория Распутина-Нового к секте хлыстов возбуждено в свое время без достаточных к тому оснований, и со своей стороны считает крестьянина Григория Нового православным христианином, человеком очень умным, духовно настроенным, ищущим правды Христовой, могущим подавать при случае добрый совет тому, кто в нем нуждается». В итоге дело было прекращено 29 ноября 1912 года.