С высокого берега далеко в море Аполлон увидел корабль критских моряков. Обернувшись дельфином, бросился он в синее море, настиг корабль и лучезарной звездой взлетел из морских волн на корму его. Аполлон привел корабль к пристани города Крисы и через плодородную долину повел критских моряков, играя на золотой кифаре, в Дельфы. Он сделал их первыми жрецами своего святилища.
В честь победы Аполлона над Пифоном в Дельфах стали регулярно устраивать Пифийские игры, которые по своему блеску и популярности уступали только Олимпийским.
На месте победы над Пифоном был воздвигнут храм.
Когда Аполлон, гордый своей победой, стоял над сраженным чудовищем, он увидел около себя юного бога любви Эрота, натягивающего тетиву своего золотого лука. Смеясь, сказал ему Аполлон:
— На что тебе, дитя, такое грозное оружие? Предоставь-ка лучше мне посылать разящие золотые стрелы.
Обиженный Эрот гордо ответил Аполлону:
— Стрелы твои, Феб-Аполлон, не знают промаха, всех разят они, но моя стрела поразит тебя.
Эрот взмахнул крыльями и взлетел на высокий Парнас. Там вынул он из колчана две стрелы: одну — ранящую сердце и вызывающую любовь, ею пронзил он сердце Аполлона, другую — убивающую любовь, пустил он в сердце нимфы Дафны, дочери речного бога Пенея.
Встретил прекрасную Дафну Аполлон и полюбил ее, Но только Дафна, увидев его, с быстротою ветра пустилась бежать, ведь стрела Эрота, убивающая любовь, пронзила ее сердце. Обратилась Дафна к отцу своему Пенею:
— Отец, помоги мне! Расступись скорее, земля, и поглоти меня!
Лишь только сказала она это, как кора покрыла ее нежное тело, волосы обратились в листву, а руки, поднятые к небу, стали ветвями. Не стало Дафны, а появился Лавр. Долго печальный стоял Аполлон пред лавром и, наконец, сказал:
— Пусть же отныне венок из твоих листьев украшает мою голову, пусть ветви твои обовьют и мою кифару, и мой колчан. Пусть никогда не вянет, о лавр, твоя зелень.
В Дельфах победителям в состязаниях в честь Аполлона вручались лавровые венки.
От Гермеса Аполлон получил в подарок лиру и стал богом муз (отсюда прозвище Аполлона — Мусагет).
Однажды, блуждая по полям Фригии, сатир Марсий нашел тростниковую флейту. Ее бросила богиня Афина, заметив, что игра на изобретенной ею самой флейте обезображивает ее божественно прекрасное лицо. Афина прокляла свое изобретение и сказала:
— Пусть же жестоко будет наказан тот, кто подымет эту флейту.
Ничего не зная о проклятии Афины, Марсий поднял флейту и вскоре научился так хорошо играть на ней, что все заслушивались. Марсий возгордился и вызвал самого покровителя музыки Аполлона на состязание.
По легенде, разгневанный дерзостью сатиров, бог содрал с Марсия кожу и повесил ее на дереве в Келенах (Фригия). Кожа Марсия при звуках флейты трепетала. По другому мифу, царь Мидас признал победителем в игре на флейте Марсия, и в наказание за это Аполлон наградил царя ослиными ушами.
В одном из мифов рассказывается, что Аполлон наделил пророческим даром троянскую царевну Кассандру в надежде на ее любовь. Когда же он был ею отвергнут, сделал так, что ее предсказаниям никто не верил.
В другом, более позднем варианте мифа, Кассандра и ее брат-близнец получили пророческий дар еще в детстве от священных змей из храма Аполлона (в Трое). Кассандра первой опознала Париса, явившегося на состязания в Трою, и хотела убить его, чтобы избавить родину от бедствий, которые позднее Парис навлек на город. Она уговаривала Париса отказаться от брака с Еленой, а затем убеждала троянцев не верить словам Синона и не вводить в Трою деревянного коня, в котором скрывались ахейцы.
Но безуспешны оказались попытки вещуньи спасти родину.
В ночь падения Трои Кассандра искала убежища у алтаря Афины, но была обнаружена Аяксом, сыном Оилея, который насильно овладел ею. При разделе добычи Кассандра досталась Агамемнону и погибла вместе с ним от руки Клитеместры, увидевшей в ней соперницу.
У Аполлона был сын Асклепий — покровитель целителей и искусства врачевания. Аполлон еще ребенком отдал сына на воспитание мудрому кентавру Хирону, который вырастил Асклепия на склонах Пелиона. Под его руководством Асклепий стал таким искусным врачом, что превзошел даже своего учителя Хирона. Символом бога-целителя была змея, получавшая в храме Асклепия жертвенные приношения. Асклепий не только исцелял все болезни, но даже умерших возвращал к жизни. Этим прогневал он властителя царства умерших Аида и громовержца Зевса, так как нарушил закон и порядок, установленные Зевсом на земле. Разгневанный Зевс метнул свою молнию и поразил Асклепия. Но люди почитали сына Аполлона как бога-врачевателя. Они воздвигли ему много святилищ, в том числе знаменитое святилище Асклепия в Эпидавре.
В римской мифологии Асклепий именуется Эскулапом. Его культ был введен в Риме в начале III в. до н. э. На одном из островов Тибра, там, где была выпущена привезенная из Эпидавра змея, был основан храм в честь бога. В искусстве Асклепия изображают похожим на Зевса, опирающимся на жезл, вокруг которого обвивается змея.