С момента смерти великого завоевателя прошло более пятисот лет. Все было спокойно до тех пор, пока в 1926 году советскому академику Массону не пришла в голову идея вскрыть его гробницу. Его заинтересовали звуки, доносившиеся из могилы Тамерлана. Но тогда у советского правительства не нашлось денег на проведение таких работ. А в 1941 году, когда они наконец отыскались, академик сам отказался участвовать в этой экспедиции. Он посчитал, что исследование с научной точки зрения обставлено слишком непрофессионально. А, возможно, Массон знал больше, чем ему полагалось, и потому уклонился от участия в «авантюрном проекте». Не исключено также, что для властей главным была совсем не научная составляющая этого мероприятия. Ведь полной уверенности в том, что Тамерлан был погребен в мавзолее Гур-Эмир, у советских ученых тогда не было.
В 1941 году в СССР торжественно отмечалось 500-летие со дня рождения великого узбекского поэта, философа и государственного деятеля Алишера Навои. Жил он в эпоху Тимуридов, сыновей и внуков великого полководца древности Тамерлана. И тогда по решению правительства Узбекской ССР были проведены раскопки усыпальницы Тимуридов в Самарканде. Такова официальная причина раскопок в мавзолее Гур-Эмир. На самом деле директиву о начале работ в усыпальнице сообщили члены советского правительства. Одной из основных задач научной экспедиции должно было стать установление точного места захоронения Тамерлана и документации, которая подтверждала бы это.
Документы на разрешение раскопок были подписаны самим Сталиным. Существует версия о том, что еще в «расстрельном» 1937 году он сам составил список людей, которые, на его взгляд, оставили яркий след в истории человечества. Внесено было в него и имя Тамерлана, которого «вождь всех времен и народов» назвал «избавителем от татаро-монгольского ига» многострадальной Руси. Это определение даже вошло в учебники истории того времени. Личность Тамерлана, несомненно, очень привлекала Сталина. Уж очень они были похожи. Даже прозвища-псевдонимы у них были схожи: один был «железным», другой — «стальным». Даже в проблемах с внешностью у них было много общего: у Тамерлана отсутствовало несколько пальцев на руке, Сталин же был сухоруким, первый был хромым, второй имел сросшиеся пальцы на ноге. Они жили в разное время, деяния их разделяли века, но было нечто, что объединяло обоих, — присущая им обоим жестокость.
Научную экспедицию, созданную в марте 1941 года, возглавил видный узбекский историк и математик, впоследствии академик и президент Академии наук Узбекистана, Ташмухамед Кары-Ниязов. В ее состав вошли: историк и знаток древних языков Востока Александр Семенов, известный археолог, антрополог и скульптор Михаил Герасимов, создавший уникальный метод восстановления внешнего облика людей на основе скелетных останков, таджикский писатель, ученый и общественный деятель Айни, эксперты ленинградского Эрмитажа, а также четыре кинооператора, которые должны были запечатлеть на пленке основные этапы и результаты работ. Курировала деятельность экспедиции большая команда Московского НКВД.
Особая задача стояла перед профессором М. М. Герасимовым. Как известно, подлинные изображения Тамерлана и Улугбека до нас не дошли, поскольку Коран запрещал рисовать человеческие лица. Но если в усыпальнице будут найдены останки великого завоевателя и его знаменитого внука, то ученый сможет в полном смысле этого слова сотворить «чудо» — воссоздать по ним внешний облик великого завоевателя.
Накануне экспедиции ученые вели долгие споры о том, где именно нужно искать прах Тамерлана. По мнению большинства, местом его упокоения стал Гур-Эмир. Некоторые историки считали, что он был погребен в родном Кеше. Именно здесь эмир повелел построить великолепный мавзолей для своих родителей. В подземной его части был установлен специальный саркофаг, закрытый мраморной плитой весом в три с половиной тонны. Что в нем находилось, в 1941 году еще никто не знал. А Александр Семенов полагал, что могилу великого завоевателя следует искать там, где он скончался, т. е. в Отраре. Остатки этого города, просуществовавшего до середины XVI века, находились в Казахстане, в районе железнодорожной станции, которая так и называлась — Тимур. Одним из аргументов в пользу своей гипотезы Семенов считал тот факт, что приближенные эмира некоторое время скрывали его смерть в надежде на удачный поход и большую военную добычу. Еще одну точку зрения высказывал Кары-Ниязов. Он был уверен, что могила Тамерлана находится в древнем афганском городе Герате, основанном еще Александром Македонским. Туда, по мнению ученого, тайно отвез скончавшегося эмира его сын Шахрух. После продолжительной дискуссии было все же решено начать поиски в столице империи Тимуридов Самарканде, поскольку именно там, в мавзолее Гур-Эмир, согласно историческим документам, находились останки ближайших родственников Тамерлана.