Появление устойчивых форм ВИЧ, не поддающихся лекарственной антиретровирусной терапии, и сопутствующее развитие СПИДа привели к вспышкам ранее поддающегося лечению и курабельного туберкулеза вследствие сопутствующей инфекции ВИЧ. В настоящее время туберкулез является наиболее распространенной оппортунистической инфекцией, встречающейся у ВИЧ-инфицированных. Среди нескольких сосуществующих серьезных проблем со здоровьем, первая заключается в том, что двойная терапия, предназначенная для лечения ВИЧ-инфекции наряду с туберкулезом, может вызывать усиление лекарственной токсичности. Вторая – это подавление иммунной системы вирусом ВИЧ, что также ограничивает ее способность бороться с возбудителем туберкулеза. Результатом является широко распространенное системное присутствие бактерий туберкулеза, напоминающее эффект, наблюдаемый фон Пирке в отношении вируса кори в 1890-х годах (см. главу 6). И третья – это селекция и эволюция устойчивых к лекарственным средствам штаммов туберкулезных бактерий, подвергающих риску не только ВИЧ-инфицированных, но и целые группы населения. Действительно, с 2006 года несколько сотен или более людей заразились устойчивыми к лекарствам туберкулезными бактериями. Бацилла Кальметта и Гирена (БЦЖ), используемая как вакцина против туберкулеза, была разработана более 100 лет назад и содержит ослабленную, но живую форму
Точно так же двойная инфекция с ВИЧ и малярией или вирусом кори способствует распространению обеих инфекций и часто приводит к тяжелым заболеваниям. Например, скачок содержания ВИЧ в крови на один-два логарифма (десятичных) сопровождает эпизоды фебрильной малярии, и подверженность малярии увеличивается во время ВИЧ-инфекции. В Кении с конца 1980-х годов около полумиллиона взрослых заболели одновременно малярией и ВИЧ-инфекцией.
ВИЧ обычно проникает в организм хозяина через жидкости (кровь или сперму) или внутри инфицированных клеток. Развивающаяся в результате персистирующая инфекция остается неизменной, несмотря на ранний иммунный ответ, сосуществующий с вирусом. Весь прошлый опыт с вакцинами против оспы, желтой лихорадки, кори и полиомиелита базировался на использовании аттенуированного вируса, способного размножаться в организме хозяина, не нанося ему серьезного вреда, но при этом обеспечивая достаточный стимул для борьбы иммунной системы с реальной вирусной инфекцией и очищение организма от вируса. Этот опыт оказался бесполезен в случае ВИЧ.