Пользуясь тем, что в нем находились корабли республиканцев, Танжер объявили временной базой флота. Вскоре тут находилась уже целая эскадра под командованием капитана флота (капитан 1-ro ранга) Педро Прадо: линкор «Jaime I», крейсеры «Libertad» и «Cervantes», эсминцы «Alsedo», «Churruca», «Ferrandiz», «Galiano», «Lepanto», «Miranda», «Valdez», миноносец № 17, канонерки «Laya» и «Uad Muluya», а также вспомогательные суда «Nador» и «Tofino».
Однако их пребывание в Танжере противоречило правовому статусу этой международной зоны, чем воспользовался Франко. Он сосредоточил на границе с зоной марокканские войска и потребовал от международной комиссии, управлявшей ею, чтобы она заставила корабли республиканцев уйти. Мадриду пришлось удовлетворить протест комиссии. Уже 25 июля республиканские корабли оставили порт (правда, отдельные суда еще несколько раз заходили в Танжер до 8 августа).
Ближайшая оперативная база республиканского флота (Малага) была удалена от Гибралтарского пролива на 62 мили (115 км). Это обстоятельство не позволяло обеспечить постоянное патрулирование в проливе. Действия республиканцев свелись лишь к обстрелу береговых объектов и к наблюдению за водами пролива с целью недопущения переброски марокканских войск по морю. Правительство, занятое в это время подавлением мятежа в метрополии, предоставило флоту действовать по собственному усмотрению. А ввиду того, что авиация мятежников все более усиливалась, лишенные поддержки с воздуха республиканские корабли могли сделать немногое. Именно поэтому, несмотря на благоприятные обстоятельства, они упустили шанс захватить один из марокканских портов посредством десанта.
22 июля крейсеры «Libertad» и «Cervantes» обстреляли Ла-Линеа, на следующий день вместе с «Jaime I» они обстреляли Сеуту, 25 июля Мелилью, на следующий день Альхесирас. Эти бомбардировки серьезно ограничили морские перевозки через пролив (до конца июля морским путем было переброшено не более 2 тысяч «регулярес»).
Но в начале августа сюда прибыли немецкие и итальянские корабли, которые открыто препятствовали действиям республиканского флота. Уже 3 августа в Сеуту вошел германский броненосец «Deutshcland». Когда отряд республиканцев (линкор «Jaime I», крейсер «Libertad», эсминец «Valdes») подошел к порту с намерением его обстрелять, «Deutschland» вышел на внешний рейд и своими маневрами не дал им возможности вести эффективную стрельбу. В тот же день корабли республиканцев обстреливали Тарифу и Альхесирас, но и здесь обстрел не удался из-за того, что на рейде Альхесираса стоял британский линкор «Queen Elisabeth». На следующий день республиканские корабли, обстреливавшие Лараче, атаковали итальянские бомбардировщики.
Приободренные помощью итальянцев и немцев, мятежники решились на проведение через пролив большого конвоя. 5 августа из Сеуты вышли пять транспортных судов (свыше 3 тысяч марокканцев и легионеров, 3 артиллерийские батареи, военные грузы), эскортируемые канонерками «Dato» и «Uad Quert», миноносцем № 19 и несколькими самолетами.
В это время восточную часть Гибралтарского пролива патрулировал эсминец «Galiano», а западную — эсминец «Lepanto». Первым атаковал конвой «Galiano». Произошла перестрелка между ним и «Dato», после чего эсминец стали бомбить самолеты. Понеся большие потери в людях (8 убитых, 28 раненых), он вернулся в Малагу. Спешивший ему на помощь «Lepanto» получил попадание бомбы и тоже лег на обратный курс, благодаря чему конвой вечером успешно прибыл в Альхесирас.
Получив сообщение о переброске марокканцев, из Малаги вышли «Jaime I», «Libertad» и «Cervantes», которые 7 августа подошли к Альхесирасу. В результате их бомбардировки была разрушена часть города и порта, потоплена канонерка «Dato» (вскоре франкисты подняли ее и отремонтировали), а несколько транспортов получили повреждения (среди них голландское судно «Dempo»).
В ответ авиация мятежников 7 августа атаковала и повредила патрулировавшую в проливе подлодку «С-3» (которую пришлось тащить в Малагу на буксире), а 13 августа она бомбила Малагу. При этом одна 250-кг бомба попала в «Jaime I» (47 убитых и раненых), незначительные повреждения получил «Cervantes».
Республиканская эскадра еще несколько раз (9―17 августа) подвергала обстрелам порты мятежниками (Сеуту, Ла-Линеа, Кадис, Тариф, Мелилью и Альхесирас), однако эти атаки становились все менее успешными из-за непрерывно усиливавшегося противодействия самолетов франкистов, пилотируемых итальянскими и немецкими летчиками.
Захват мятежниками Балеарских островов (за исключением Майорки) создал серьезную угрозу для восточного побережья республики. На островах были удобные аэродромы и порты. Поэтому автономное правительство Каталонии (Генералидад) предприняло в конце июля попытку отбить острова с помощью десантной операции. Кроме того, оно намеревалось включить архипелаг в состав автономного округа «Великая Каталония».