Знаменитый шаман черноногих Пятнистый Орел так объяснил Мак-клинтоку, откуда пошел кровавый обычай. Старик, сотворивший черноногих и весь окружающий их мир, как-то раз играл с другим Стариком, сотворившим людей на другой стороне гор. После того как Старик черноногих проиграл всю дичь, он поставил на кон свою голову против головы Старика из-за гор и выиграл. Он снял с него скальп и повелел ему: «Когда кто-либо из твоих юношей убьет кого-либо из моих, пусть снимет с него скальп.
Мои станут делать то же самое и благодаря этому станут вождями». Вильям Кларк отмечал, что черноногие рассказали ему две разные легенды. Одна полностью совпадает с вышеприведенной, но в его варианте объясняется, почему Старик черноногих поступил гуманно и не отрезал противнику поставленную им на кон голову, а лишь снял скальп. Он сохранил ее Старику с другой стороны гор, обменяв на проигранных животных. Вторая легенда гласит, что однажды пиеганы столкнулись с шошонами. Оба племени одновременно подошли к реке с разных сторон. Из-за быстрого течения перебраться на другой берег было очень трудно. Тогда шошоны знаками предложили пиеганам, чтобы каждое племя отобрало по одному храбрейшему воину, которые в бою решат спор. Оба бросились в реку, и пиеган утопил шошона. Тело погибшего поплыло вниз по течению. Несколько пиеганов побежали за ним, вытащили на берег и срезали с него скальп в качестве свидетельства величайшей храбрости и силы пиеганов. Существует и еще одна версия происхождения обычая. Кларк Висслер приводит миф черноногих о Шрамолицем, в котором тот получил следующие инструкции от Солнца: «Когда твои люди будут убивать врагов, они должны скальпировать их и исполнить Пляску Скальпов».
Часто упоминается, что скальпирование врага связано с нанесением вреда душе погибшего. По сведениям Стэнли Вестала, многие сиу считали, что качества убитого противника переходили его убийце, что также может косвенно относиться и к обычаю скальпирования. Ричард Додж писал, что старики шайенов и арапахо говорили ему о поверье, существовавшем в прошлом среди всех индейцев, живших между рекой Миссисипи и Скалистыми горами, по которому скальпирование головы убивало душу врага – то есть обычай этот был распространен из-за желания каждого воина нанести вред врагу в жизни последующей. Но в 1880-х годах капитан Вильям Кларк сообщал: «Я провел специальные изыскания в связи с этим обычаем среди следующих племен: шайенов, арапахо, сиу, команчей, кайовов, кайова-апачей, вичитов, пауни, сауков и фоксов, ото, айовов, кикапу, ютов, черноногих, бладов, пиеганов, арикаров, хидатсов, манданов, шошонов, банноков, неперсе, пан д’орей, кутеней, кэддо, понков, шауни, семинолов, чиппевов (оджибвеев), кроу, гровантров и ассинибойнов. Ни в одном из них я не смог обнаружить никаких суеверий или фантазий относительно того, что скальпирование человека каким-то образом наносило ущерб его душе после смерти».
Большинство индейцев считало, что воин, погибший в бою и скальпированный, отправится в Земли Счастливой Охоты, где будет принят с почестями, с которыми встречают удачливый военный отряд, а умерший от старости или болезни таких почестей не получит.
По мнению автора, разгадка происхождения этого обычая кроется в самой манере ведения индейской войны, где основная роль возлагалась на небольшие отряды воинов, проникавшие на отдаленные земли враждебных племен. Домой они должны были принести доказательство смерти врага. Различные части вражеского трупа всегда использовались для победных плясок – до конца XIX века, помимо скальпов, для этих целей могли служить отрубленные головы, руки, ноги, кисти и стопы. Но, в отличие от них, скальп не портился и был более компактен при длительном переходе.
Чарльз Бюло, переводчик из агентства Белой Земли, писал: «Я узнал, что, когда впервые разгорелась война между сиу и оджибвеями, среди воинов оджибвеев начали возникать споры по поводу храбрости каждого из них, поскольку во многих случаях отъявленные трусы заявляли о своей храбрости. И потому было решено снимать с голов врагов скальпы в качестве доказательства своей доблести». В дальнейшем скальп еще долго мог служить доказательством победы над врагом, украшая оружие, щиты и т. п. Эту же мысль в какой-то мере подтверждает фраза, сказанная одним из черноногих: «Мы снимаем скальпы, чтобы война была жестче, и когда наши женщины и дети видят скальпы врагов, их сердца охватывает радость».