Но англичане лишились этого преимущества после того, как Дениц начал оснащать свои лодки радиолокационной станцией "Метокс", которая засекала работу поисковых радиолокационных станций самолетов на значительно большем расстоянии. Но в начале 1943 года английские самолеты внезапно снова начали успешно атаковать подводные лодки в надводном положении, причем их радиолокационная станция "Метокс" теперь почему-то не давала никаких показаний. Считая, что работа станции "Метокс" демаскирует лодку, Дениц приказал прекратить ее использовать. В действительности же англичане создали новую, сверхвысокочастотную радиолокационную станцию, работу которой "Метокс" обнаружить не мог. В сочетании с применявшимся самолетами мощным поисковым прожектором новая радиолокационная станция позволяла самолетам внезапно атаковать лодки и ночное время. В течение марта и апреля 1943 года многие из этих атак не имели успеха, потому что подводные лодки, обнаружив приближающуюся опасность, успевали уйти на глубину. Пока немецкие ученые пытались улучшить радиолокационную станцию "Метокс", Дениц вооружил лодки дополнительным зенитным оружием и, отменив свои прежние указания, распорядился, чтобы и в дневное, и в ночное время переходы в Бискайском заливе лодки совершали в подводном положении, всплывая для зарядки батарей только в дневное время. Дениц рекомендовал также командирам подводных лодок, в случае если атакующий самолет находится слишком близко и срочное погружение невозможно, вступать с ним в бой. Хотя в течение первых трех недель июля английским бомбардировщикам удалось потопить в Бискайском заливе шесть подводных лодок, настоящее наступление самолетов началось лишь 28 июля. В течение следующей недели американские и английские самолеты и английская 2-я группа поддержки потопили девять подводных лодок. Это заставило Деница не только отказаться от группового использования подводных лодок, но и вообще запретить в начале августа выход лодок из баз в Бискайском заливе. Таким образом, наступление авиации в Бискайском заливе привело фактически к блокаде флотилий подводных лодок, базировавшихся на порты западного побережья Франции. Позднее немецкое командование начало выводить лодки в океан по маршруту вдоль северного побережья Испании, где обнаружить их радиолокационной станцией было невозможно. Всего в течение кампании в Бискайском заливе было потоплено 28 лодок, пытавшихся выйти в океан.
Последняя фаза борьбы за Северную Атлантику
19 сентября 1943 года, после трехмесячных сравнительно безрезультатных действий в Центральной Атлантике и в Бискайском заливе, Дениц приказал нанести еще один удар по конвоям союзников, переходившим по основным маршрутам в Северной Атлантике. Он готовился применить новое оружие - акустическую торпеду, которая должна была наводиться на цель шумом работающих винтов корабля. Эта торпеда предназначалась для поражения эскортных кораблей, после чего подводная лодка могла прорваться сквозь завесу охранения и атаковать охраняемые торговые суда конвоя обычными торпедами. В сентябре группа немецких лодок нанесла удар по шедшим на запад конвоям "ONS-202" и "ONS-18"; лодкам удалось потопить три эскортных корабля, одному нанести повреждения и послать на дно шесть торговых судов. Для борьбы с акустическими торпедами английские и американские корабли начали применять специальные буксируемые шумовые устройства, которые наводили на себя торпеды, и они взрывались, не причиняя вреда кораблю.
В конечном итоге это наступление немецких подводных лодок в Северной Атлантике было значительно ослаблено в результате систематического круглосуточного патрулирования авиации ближней поддержки при прохождении конвоев в зонах наиболее активных действий подводных лодок. Прикрытие конвоев с воздуха обеспечивалось авиацией наземного базирования, взаимодействовавшей с самолетами, которые взлетали с эскортных авианосцев, входивших в состав конвоев или в состав английских надводных противолодочных сил поддержки. Группы кораблей огневой поддержки совместно с авиацией наземного базирования обеспечивали теперь прикрытие конвоев и в дневное, и в ночное время. Эти контрмеры союзников оказались столь эффективными, что в октябре Деницу пришлось отозвать свои лодки. В октябре он попытался сконцентрировать их южнее Исландии, но и здесь авиацией наземного базирования были потоплены три лодки. Дениц понимал огромную опасность, создаваемую нападениями на конвои в Северной Атлантике, но тем не менее продолжал посылать туда лодки до февраля 1944 года, неся тяжелые потери и причиняя судоходству союзников лишь незначительный урон. Комбинированное использование надводных эскортных кораблей, авиации наземного базирования и противолодочных групп с эскортными авианосцами для обеспечения ближнего воздушного прикрытия сделало конвои в Северной Атлантике почти неуязвимыми для атак подводных лодок.