Вопрос жизни. Энергия, эволюция и происхождение сложности

Alberts, A., Johnson, A., Lewis, J., Raff, M., Roberts, K., and P. WalterMolecular Biology of the Cell. 5^th edn. Garland Science, New York (2008).

Allen, J. F.Control of gene expression by redox potential and the requirement for chloroplast and mitochondrial genomes // Journal of Theoretical Biology 165: 609–631 (1993).

Allen, J. F.The function of genomes in bioenergetic organelles // Phil. Trans. R. Soc. B 358: 19–37 (2003).

Gray, M. W., Burger, G., and B. F. LangMitochondrial evolution // Science 283: 1476–1481 (1999).

Grey, A. D. deForces maintaining organellar genomes: is any as strong as genetic code disparity or hydrophobicity? // BioEssays 27: 436–446 (2005).

Полиплоидия у цианобактерий

Griese, M., Lange, C., and J. SoppaPloidy in cyanobacteria // FEMS Microbiology Letters 323: 124–131 (2011).

Почему на пластиды действуют те же энергетические ограничения, что на бактерии

Lane, N.Bioenergetic constraints on the evolution of complex life // Cold Spring Harbor Perspectives in Biology, doi: 10.1101/cshperspect.a015982 (2014).

Lane, N.Energetics and genetics across the prokaryote-eukaryote divide // Biology Direct 6: 35 (2011).

Конфликт направлений действия естественного отбора на разных уровнях и решение этой проблемы в рамках эндосимбиоза

Blackstone, N. W.Why did eukaryotes evolve only once? Genetic and energetic aspects of conflict and conflict mediation // Phil. Trans. R. Soc. B 368: 20120266 (2013).

Martin, W., and M. Müller The hydrogen hypothesis for the first eukaryote // Nature 392: 37–41 (1998).

Бактерии и использование энергии

Russell, J. B.The energy spilling reactions of bacteria and other organisms // Journal of Molecular Microbiology and Biotechnology 13: 1–11 (2007).

Глава 6.

Половое размножение и происхождение смерти

Скорость эволюции

Conway-Morris, S.The Cambrian “explosion”: Slow-fuse or megatonnage? // Proceedings National Academy Sciences USA 97: 4426–4429 (2000).

Gould, S. J., and N. EldredgePunctuated equilibria: the tempo and mode of evolution reconsidered // Paleobiology 3: 115–151 (1977).

Nilsson, D.-E., and S. PelgerA pessimistic estimate of the time required for an eye to evolve // Proc. R. Soc. B 256: 53–58 (1994).

Половое размножение и структура популяции

Lahr, D. J., Parfrey, L. W., Mitchell, E. A., Katz, L. A., and E. LaraThe chastity of amoeba: re-evaluating evidence for sex in amoeboid organisms // Proc. R. Soc. B 278: 2081–2090 (2011).

Maynard-Smith, J.The Evolution of Sex. Cambridge University Press, Cambridge (1978).

Ramesh, M. A., Malik, S. B., and J. M. LogsdonA phylogenomic inventory of meiotic genes: evidence for sex in Giardia and an early eukaryotic origin of meiosis // Current Biology 15: 185–191 (2005).

Takeuchi, N., Kaneko, K., and E. V. KooninHorizontal gene transfer can rescue prokaryotes from Muller’s ratchet: benefit of DNA from dead cells and population subdivision // Genes Genomes Genetics 4: 325–339 (2014).

Происхождение интронов