Признание мастерства Н.Ф. Арендта нашло своё отражение в беспрецедентном в истории отечественной медицинской науки акте: «за усердную и долговременную службу, равно как и за совершенное познание медицины и хирургии, доказанное многократным производством всех операций», ему в 1821 г. была присуждена учёная степень доктора медицины и хирургии без сдачи обязательного экзамена и защиты диссертации.
По данным А.Н. Никитина и Е.И. Андреевского, за время военной службы Н.Ф. Арендт произвёл более 800 операций.
Уже упоминавшийся английский хирург Аугуст Боцций Гранвилл, сравнивая уровень медицинской помощи в России с существующим уровнем врачевания в Германии, Франции, Италии и Англии, находил, что врачам, практиковавшим в России, недостаёт опытности, свойственной немецким врачам, в основу лечения русскими врачами положен метод выжидания, но оно продолжительнее, чем во французской медицине, русские врачи менее решительны в терапии и менее склонны к философии, чем врачи Северной Италии, врачевание русских врачей не столь действенно и успешно, как английских, потому что метод выжидательного лечения основывается на устаревших данных об отправлениях отдельных органов и тканей. Гранвилл также отмечал, что в Петербурге было мало русских врачей — преобладали врачи-иностранцы: немцы, французы, англичане, итальянцы, являвшиеся поклонниками различных систем, в соответствии с которыми нередко проводили лечение. Среди этих врачей-иностранцев Гранвилл упоминает хирургов-англичан лейб-медиков В.П. Крейтона и Я.И. Лейтона. Он также сообщает о врачебно-организационной деятельности Я.В. Виллие, И.Ф. Рюля и О.О. Ремана, тоже лейб-медиков. Что же касается уровня развития хирургии, то Гранвилл особенно подчёркивал способности Н.Ф. Арендта, сравнивая его с известными английскими хирургами Э. Купером, Б. Броуди, а также с Г. Дюпюитреном, считая, что хирургическое мастерство Н.Ф. Арендта «делало честь России».
В 1827 г. Н.Ф. Арендт ушёл в отставку с военной службы и вскоре был приглашён на должность главного консультанта знаменитой Обуховской больницы. После успешного лечения Николая I Н.Ф. Арендт в 1829 г. был пожалован званием лейб-медика и до 1839 г. являлся личным врачом императора. Придворные обязанности не изменили привычек Н.Ф. Арендта. «Он занимался частной практикой, не отказывая никому в помощи. Он сокращал иногда визит в богатом доме, чтобы не опоздать в тесную и грязную лачужку какого-нибудь дворника… Были годы, которые Арендт прожил, почти не выходя из коляски: так много было у него больных. Но между этими больными едва ли одна треть имела возможность заплатить за его попечение. Напротив, весьма многим бедным людям сам он вместе с советом привозил и деньги за исполнение совета. Но зато в последние двадцать лет едва ли можно было встретить в Петербурге бедняка, который бы не знал Николая Фёдоровича и ничем не был обязан ему».
Иногда для этого приходилось использовать и дворцовые связи. Ассистент Н.Ф. Арендта Иван Соколов рассказывает: «Он был приглашён к одному труднобольному отставному полковнику, живущему в одной из дальних линий Васильевского острова, где он был поражён бедной обстановкой больного и его большой семьи, и т.к. это обстоятельство служило неодолимым препятствием к восстановлению здоровья больного, то Арендт полюбопытствовал узнать причины такого положения. Семья рассказала, что болезнь и бедственное положение произошли вследствие увольнения больного от службы без всяких прав. Лейб-медики обязаны были ежедневно являться к государю к 7–8 часам утра, когда приготовляется чай или кофе, и в это время обыкновенно завязывается не служебный, а простой разговор. В одно из таких посещений Арендт рассказал о положении больного и его семьи. Государь (Николай I. —
Арендт был лично знаком со многими знаменитыми врачами Европы, а с некоторыми из них, например с профессором Диффенбахом — руководителем хирургического отделения больницы Шарите в Берлине — состоял в дружеской переписке.
Николай Фёдорович всегда благожелательно относился к молодым хирургам, он одним из первых оценил талант молодого Пирогова и добился для него разрешения от государя прочесть в покойницкой Обуховской больницы цикл лекций по новой тогда медицинской специальности — хирургической анатомии.
Пирогов впоследствии вспоминал: «Каково же было моё изумление, когда среди своих слушателей я увидел почтенного доктора медицины и хирургии Арендта, ставшего внимательным учеником и не пропустившего буквально ни одной лекции».