Однако другие ведущие лондонские хирурги, подобно Вуду, начали признавать достоинства не только практического применения методов Листера, но и убедительность принципов, вытекающих из бактериальной теории. На встрече, состоявшейся в больнице Сент-Томаса в декабре 1879 года, Листера приветствовали те же люди, которые когда-то были его оппонентами. В 1883 году Александр Огстон, бывший ученик из Абердина, написал ему письмо, под которым вполне мог бы подписаться любой из постоянно возрастающего числа его последователей: «Вы изменили хирургию, особенно оперативную хирургию, превратив ее из рискованной лотереи в безопасную, основанную на науке область медицины; вы лидер современного поколения хирургов-ученых, и каждый рассудительный и достойный профессионал, особенно в Шотландии, относится к вам с нечасто встречающимся уважением и преклонением». Вскоре после этого королева Виктория посвятила Листера в рыцари. По иронии судьбы, это произошло в тот же год, когда он, стоя с Томсоном на лестнице Королевского колледжа, был на грани отчаянья из-за того, насколько медленно мир постигал его учение.
С этого момента фортуна решительно повернулась лицом к нему, скорее, даже лицом к науке. Призы и награды посыпались на только что посвященного сэра Джозефа со всех сторон. Теперь он стал рыцарем Прусского ордена и кавалером Датского ордена, получил медали и различные почетные звания, среди которых была докторская степень от Оксфорда и Кембриджа, институтов, в которые сорок лет назад Листер не мог поступить из-за своей принадлежности к религиозному обществу квакеров. Он был награжден премией Франции Будэ за применение открытий Пастера в медицине и орден Пруссии за заслуги. Медицинские общества по всему миру тут же сделали его своим почетным членом.
Постепенно методы Листера и бактериальная теория все в большей степени становились частью повседневной медицинской практики. Пастер продолжал свои исследования, получая все более убедительные доказательства того, что именно микробы провоцируют развитие инфекционных заболеваний. К тому же тридцатичетырехлетний немецкий бактериолог Роберт Кох в 1876 году впервые идентифицировал специфическую бактерию, вызывающую конкретную болезнь, продемонстрировав с помощью серии простых, понятных экспериментов, что бацилла, выделенная из крови страдающих сибирской язвой животных, является прямым агентом, вызывающим связанные с этим заболеванием патологические изменения при введении их в организм здоровых животных. Результаты исследований Коха вскоре были подтверждены Пастером, который, как отмечалось ранее, разработал метод вакцинации против сибирской язвы, используя бациллы с ослабленной патогенностью. В 1878 году Кох опубликовал свою монументальную работу «Исследования этиологии инфицирования ран», в которой связал шесть различных видов хирургических инфекций с шестью различными бактериями. Эта статья стала последним недостающим фрагментом доказательства идеи Листера, вдохновленного научными изысканиями Пастера. Последние сомнения в бактериальной теории были окончательно развеяны. Ее справедливость оставалась под вопросом только для не связанных с наукой людей и Лоусона Тайтса, по-прежнему относившегося к ней с недоверием.
Парадоксальность медицины в это время ощущалась как никогда. Некоторые ученые, и Листер в их числе, пришли к осознанию того, что в воздухе роится гораздо меньшее количество микробов, чем считалось ранее. В результате сэр Джозеф решил отказаться от применения едкого карболового спрея. Но некоторые более молодые медики зашли в интерпретации этого факта гораздо дальше. Они пришли к выводу, что организмы, вызывающие воспаление и нагноение хирургических ран, не попадают в них из атмосферы, а заносятся иным путем. В то же время они догадались, что тело обладает защитными свойствами, которые делают его невосприимчивым к малым дозам бактерий, обитающим в воздушном пространстве. Таким образом, очевидными источниками основного загрязнения ран были руки и инструменты медицинского персонала – врачей и медсестер. Раневая инфекция была одним из феноменов, существовавших на этой земле задолго до Уолта Келли и героя его комикса Пого, сказавшего бессмертные слова: «Мы встретили врага, и оказалось, что он – это мы сами».
Из вышеперечисленного следовало, что дезинфицировать необходимо не рану, как считал Листер, а скорее каждый посторонний загрязненный бактериями предмет, который соприкасается с тканями организма. Так родилось учение об асептике.