Конфигурация башни, в сравнении, с Туре 98, также изменилась. За счет размещения дополнительного оборудования и ПТУР её пришлось сделать более массивной, что привело к образованию подзора между корпусом и башней. При попадании снаряда это увеличивает вероятность отрыва башни от корпуса.
Поверх основной брони разместили встроенные пакетно-модульные блоки динамической защиты, причем в передней проекции башни их расположили «углом». Дополнительно модулями закрыли борта и удлиненную кормовую нишу, где их разместили поверх решетчатой корзины.
Вооружение осталось «классическим»: 125-мм пушка, 7,62-мм спаренный и 12,7-мм зенитный пулеметы. В боекомплект орудия (42 выстрела), кроме обычных боеприпасов, входят бронебойные подкалиберные снаряды с сердечником из обедненного урана. Также китайцы заявляют, что им удалось создать новый подкалиберный снаряд с соотношением длины к диаметру 30:1 и начальной скоростью 1780 м/с, что на дистанции 2000 м обеспечивает пробитие брони толщиной до 850 мм. Для сравнения: снаряд израильской разработки М711 аналогичной конструкции имеет соотношение длины к диаметру 20:1, начальную скорость 1700 м/с и бронепробиваемость 600 мм.
На танк установили автомат заряжания карусельного типа емкостью в 22 выстрела, конструкция которого основана на российском прототипе. Управляемое вооружение представлено противотанковым ракетным комплексом, аналогичным российскому 9М119 «Рефлекс».
К вспомогательному вооружению относятся спаренный с пушкой 7,62-мм пулемет Туре 86 (боекомплект 2000 патронов) и расположенный перед люком командира 12,7-мм зенитный пулемет W-85 (боекомплект 300 патронов). Турельная установка крупнокалиберного пулемета QJC-88 позволяет вести огонь в переднем секторе на дистанции до 1600 м по наземным и 1500 м по воздушным целям. Диапазон вертикальной наводки находится в пределах от -4° до +75°.
Система управления огнем включает двухканальный прицел наводчика со встроенным лазерным дальномером, панорамный комбинированный прицел командира, двухплоскостной стабилизатор вооружения, набор датчиков внешних условий, износа канала ствола и цифровой баллистический вычислитель. Особенностью конструкции является способность командира управлять оружием помимо наводчика — включая целеуказание, сопровождение цели и стрельбу. Кроме того, для наблюдения за полем боя в его распоряжении имеются шесть панорамных перископов. ZTZ-99 оснащен также системой обработки поступающей от средств наблюдения информации, включая данные с устройств навигации, оснащенных спутниковым (GPS) и инерциальным каналами. Обстановка «наносится» на цифровую карту местности и отображается на цветных мониторах, что позволяет в реальном времени следить за полем боя. Подобно Туре 98, новый танк получил систему активного лазерного противодействия JD-3.
Силовая установка включает дизельный двигатель водяного охлаждения с турбонаддувом, созданный на базе германского МВ871 Ка 501 мощностью 1500 л.с., что даёт величину удельной мощности, по меньшей мере, в 27 л.с./т (для сравнения, у американского «Абрамса» — 23,8 л.с./т) позволяет развивать скорость по шоссе до 80 км/ч (по пересеченной местности — до 60 км/ч). Тронувшись с места, машина способна за 12 секунд разогнаться до 35 км/ч. Трансмиссия гидромеханическая, аналогичная таковой Туре 98, имеет семь скоростей для движения вперед и одну — назад. Благодаря улучшенной, в сравнении с Type 90-II, компоновке удалось снизить высоту моторно-трансмиссионного отделения.
Трансмиссия сблокирована с двигателем в единый силовой блок, замена которого в полевых условиях производится в течение 30–40 минут. Ходовая часть применительно к одному борту включает шесть двускатных опорных катков с резиновыми бандажами, четыре поддерживающих ролика и ведущее колесо заднего расположения. Подвеска торсионная с гидроамортизаторами. Гусеницы оснастили резино-металлическими шарнирами.
Уже после начала серийного производства ZTZ-99 китайские конструкторы продолжали непрерывно совершенствовать своё детище, что привело к появлению следующих модификаций:
ZTZ-99
— базовая модификация конца 1990-х годов;ZTZ-99G
— модернизированный вариант начала 2000-х годов: внесены изменения в прицельный комплекс и добавлен ряд новых приборов, модернизирована система лазерного противодействия.