После прорыва немецкой линии обороны главным препятствием для войск Жукова была река Пилица. Все командиры понимали, что очень важно двигаться быстро, чтобы не дать немцам возможности закрепиться. Полковник, командир гвардейской танковой бригады, не захотел ждать прибытия техники для наведения мостов. Решив, что в этом месте река неглубока, он просто приказал своим танкистам проломить лед выстрелами из танковых орудий и двигаться по дну, что стало страшным испытанием для водителей. На правом фланге Жукова 47-я армия окружила руины Варшавы, а Первая армия Войска Польского вошла в предместья города.
Гитлер был вне себя, когда слабый немецкий гарнизон польской столицы сдался. Он увидел в этом еще одно подтверждение измены в Генштабе, трех офицеров забрало гестапо. Даже Гудериану пришлось пройти через допрос у Кальтенбруннера. Гитлер вернулся в Берлин из своей ставки в Зигенберге для руководства войсками, что привело к предсказуемо катастрофическим результатам. Он не позволял никому из генералов отступать. А из-за скорости советского продвижения и отсутствия связи в войсках любая информация, на которой он основывал свои решения, уже устаревала. К тому времени, когда его приказы попадали на фронт, они устаревали на сутки.
Гитлер вмешивался в руководство войсками, не ставя в известность и Гудериана. Он решил передислоцировать корпус
Черняховский обнаружил, что оборона немцев на Инстербургской линии в Восточной Пруссии гораздо сильнее, чем ожидалось. Поэтому грамотным маневром он отвел 11-ю гвардейскую армию, провел ее в тылу других трех армий и направил на северный фланг вражеской обороны, который был менее защищенным. В соединении с наступлением 43-й армии через реку Неман в районе Тильзита этот прорыв посеял панику в немецком тылу.
Армии Рокоссовского, ударившие с юга, стремились к устью Вислы, чтобы отрезать Восточную Пруссию полностью. 20 января Ставка неожиданно приказала Рокоссовскому наступать также и на северо-восток, чтобы помочь Черняховскому. Менее чем через два дня 3-й гвардейский кавкорпус на правом фланге вошел в городок Алленштайн. На следующий день передовые части 5-й гвардейской танковой армии генерал-полковника Вольского обошли Эльбинг и вышли на побережье Фриш-Гаф (теперь – Калининградского залива) – длинной замерзшей лагуны, отделенной от Балтийского моря песчаной косой. Восточная Пруссия была почти полностью отрезана. Немного западнее устья Вислы находился концлагерь Штутхоф. Лагерная охрана, напуганная приближением Красной Армии, убила 3 тыс. евреек, стреляя, или выгоняя их на тонкий лед, чтобы они провалились в ледяную воду.
Эрих Кох, гауйляйтер Восточной Пруссии, все еще отказывался разрешить эвакуацию мирного населения. Они слышали отдаленные залпы артиллерии, когда началось советское наступление, но их просьбы об эвакуации отклонялись местными руководителями нацистской партии. В большинстве случаев эти чиновники сами удрали, бросив население на произвол судьбы. Отступающие немецкие солдаты оповещали все хутора и деревни, побуждая всех бежать как можно быстрее. Некоторые, особенно старики, кто не мог оставить свой дом, решили остаться. Поскольку почти все мужчины были призваны в фольксштурм, женщинам пришлось запрягать повозки, возможно, иногда с помощью работавших на немцев пленных французов, и загружать их одеялами и едой для себя и детей. Колонны беженцев двигались через заснеженные поля при морозе до минус 20 градусов.
Беженцы из Кенигсберга думали, что благополучно бежали на поезде, но когда добрались до Алленштайна, их вытащили из вагонов советские солдаты 3-го гвардейского кавкорпуса, обрадованные, что обнаружили такой источник добра и женщин. Большинство из тех, кто пытался бежать по дороге, были перехвачены советскими войсками. Некоторых просто раздавили в повозках гусеницы советских танков. Других ждала еще худшая судьба.