На момент расформирования 601-й авиабазы в Луговой имелось 34 истребителя МиГ-29 («9-12» и «9-12Б») и семь «спарок» МиГ-29УБ. Один из МиГ-29УБ (№73), поврежденный еще во времена СССР, был списан в 2002 г. и отправлен железнодорожным транспортом в Актобе, в Военный институт СВО. В 2005 г. сюда передали еще один МиГ-29 (№16), а «спарка» позднее вошла в состав экспозиции музея вооружения и военной техники в Астане.
С конца прошлого десятилетия часть МиГ-29, эксплуатируемых в Жетыгене, прошла капитальный ремонт на Украине, на Львовском государственном авиаремонтном заводе. Всего в период с 2009 по 2012 гг. во Львове было отремонтировано девять одноместных МиГ-29 (получили новые бортовые номера с 12 по 21 без №13) и пять двухместных МиГ-29УБ (№40, 41, 42, 44, 45).
Один из казахстанских МиГ-29УБ был потерян в катастрофе 12 февраля 2008 г Из-за отказа в системе управления силовой установкой экипаж катапультировался на высоте 100-150 м, при этом один летчик – майор Александр Ковязин погиб, а летчик-инструктор подполковник Виталий Дильмухамедов получил тяжелые травмы. Первоначально казахстанская сторона хотела предъявить претензии Луцкому авиаремонтному заводу (Украина), где незадолго до катастрофы проходили ремонт двигатели для этого самолета. Но затем, в результате расследования, была установлена истинная причина катастрофы, которая оказалась связанной с довольно редким отказом в системе электрооборудования. Как заявил в марте 2008 г. на пресс-брифинге на авиабазе Жетыген главнокомандующий СВО ВС Казахстана генерал-майор авиации Александр Сорокин, «в результате работы по расследованию авиапроисшествия комиссия и группа российских специалистов пришли к единому заключению, что причиной явилось снижение напряжения в системе электроснабжения самолета по постоянному току менее 14 В из-за отключения генератора постоянного тока, обусловленного отказом блока регулирования и защиты», что привело «к снижению тяги правого двигателя из-за перехода управления правового двигателя на резервную гидромеханическую систему и, как следствие, невозможности выполнения дальнейшего полета».
К настоящему времени в составе СВО РК числится 38 истребителей МиГ-29 – 33 одноместных и пять «спарок». Но в ближайшее время эта цифра может существенно измениться: в июне 2014 г. на официальном интернет-портале РГП «Казспецэкспорт» была размещена информация о торгах по реализации неиспользуемого военного имущества Минобороны РК. Среди обширного перечня военной техники на продажу выставлено и 14 самолетов МиГ-29 выпуска 1984-1988 п., оцененные «Казспецэкспортом» в 0,64-1,45 млн долл. за единицу. Исходя из этого, можно утверждать, что сегодня пригодными к эксплуатации в ВВС Казахстана остается не более 24 истребителей МиГ-29.