В 1939 году советской военной разведке удалось получить сведения и о втором бактериологическом отряде Квантунской армии. Этот второй центр в целях маскировки назывался «Иппоэпизоотическое управление Квантунской армии». Возглавлял этот центр генерал-майор ветеринарной службы Вакамацу. Формально сотрудники центра должны были беспокоиться о здоровье лошадей, огромное количество которых было в войсках Квантунской армии. Фактически японские ветеринары этой лаборатории занимались разведением бактерий острых болезней, поражающих животных — тех же лошадей и крупный рогатый скот. Цель — заражение сапом, сибирской язвой и другими болезнями животных на советской и китайской территориях.
Вторая японская бактериологическая лаборатория была размещена в местечке Могатон, в 10 километрах южнее города Чаньчунь. Производственный отдел этого отряда имел шесть отделений. В них размножались не только бактерии сибирской язвы, сапа, но и микробов для заражения хлебных злаков с целью их уничтожения, а также разводились специальные бактерии чумы для поражения крупного рогатого скота.
Японское командование, размещая вторую бактериологическую лабораторию в Могатоне, допустило роковую ошибку. Командующий Квантунской армии и его контрразведка не знали, что неподалеку от лаборатории в городе Чанчун действовала еще одна резидентура советской военной разведки. Ее деятельностью руководили различные офицеры Разведывательного управления Красной армии. Накануне и в первые годы Великой Отечественной войны этой резидентурой руководил опытный разведчик, уже работавший советником в Китайской красной армии в 1927–1929 годах, генерал-майор В. И. Чуйков, ставший впоследствии маршалом Советского Союза. Когда Чуйков был вызван в Москву и получил назначение на должность командующего 62־й армией, которой предстояло защищать Сталинград, резидентом в Чанчуне был назначен генерал-майор А. В. Рузанков.
Отряды Исии и Вакамацу имели филиалы, которые располагались на основных стратегических направлениях, ведущих к границе Советского Союза, они были укомплектованы специалистами-бактериологами. В составе отрядов действовали научные и технические сотрудники, число которых постоянно увеличивалось.
Дальневосточные резидентуры советской военной разведки взяли под контроль и эпидемиологическую обстановку в Маньчжурии. Сделать это было непросто. Во-первых, потому, что настоящей биологической разведкой должны заниматься специальные подразделения, которые должны устанавливать факты применения противником биологического оружия, определять средства и способы его применения, а также устанавливать виды возбудителей инфекций. Таких специалистов в резидентурах в Харбине и Гирине в 1938–1940 годах не было. Тем не менее военным разведчикам удавалось собирать сведения, которые представляли особый интерес для руководства военной разведки. В Центр стали поступать донесения о случаях появления в разных районах Северного Китая заболеваний чумой, тифом и другими заразными болезнями, которых ранее не было в тех местах.
Резидентурой военной разведки в Харбине в 1937–1939 годах руководил резидент «Лавров». Сотрудники его резидентуры старались держать под контролем «Управление по водоснабжению Квантунской армии». Но это не всегда получалось. Тем не менее кое-какие сведения об этом «Управлении по водоснабжению…» удавалось добывать. То ли чумные блохи могли убегать из лаборатории генерала Исии, то ли кто-то «выпускал их на свободу» умытленно.
24 июня 1938 года резидент «Лавров» докладывал в Центр:
6 июля того же года «Лавров» прислал в Центр новое донесении, в котором сообщал: «В уезде Тунляо за июль месяц отмечено несколько случаев смерти от чумы…»
Под кон тролем военных разведчиков находились и грузы, которые прибывали из Японии в Маньчжурию по заказам генерала Исии. Задачи по сбору сведений о таких грузах решали военные разведчики, действовавшие в Дайрене. Через этот корейский портовый город также перебрасывались и специальные команды, одетые в гражданскую одежду, не имевшие никаких опознавательных признаков, но слаженно, дисциплинированно, как военные подразделения. Прибытие каждой такой команды отмечалось агентами резидентуры, устанавливались места, в которые они направлялись из Дайрена. Как правило, путь их лежал в Харбин и Могатон.