На эти патриотические призывы отца Скобеева явились вооруженные крестьяне в великом множестве и, действуя заодно с казаками, а иногда и без них, энергично отражали неприятеля. Военные заслуги отца Иоанна особенно проявились при штурме генерал-майором Дороховым города Вереи и при уничтожении неприятельских укреплений. Собрав спешно 1 000 крестьян Вышегорской волости, отец Скобеев направил этот отряд в город Верею, где и были срыты на Земляном валу неприятельские укрепления по указанию Дорохова. Не бездействовал в это время и сам отец Иоанн. Он лично «изыскал во многих домах скрывшихся неприятелей, сожег неприятельские ворота, фуры, брички и прочее, закопал мертвые тела, очистил собор от всякия нечистоты». Кроме того, исполняя просьбу Дорохова, пастырь-герой озаботился изготовлением подвод для раненых воинов и собрал поспешно, ночью, 500 конных вооруженных крестьян, которые стали под команду Дорохова и усилили его отряды. Крестьяне с полною готовностью шли на все призывы отца Скобеева, так как имя его хорошо было известно всему окрестному населению, он пользовался большим нравственным влиянием и авторитетом во всей округе».
Чаще всего партизанские отряды возглавляли люди, подобные отцу Иоанну – находящиеся в постоянном контакте с простым народом и обладающие заслуженным авторитетом, они в то же время выделялись из большинства своим общественным положением и образованием. Командирами отрядов становились также старосты и приказчики.
Из другого документа видно, что отец Иоанн «20 лет был увещателем во всех присутственных местах».
Такая должность требовала обостренного чувства справедливости и незаурядного умения ладить с людьми. В обязанности увещевателя входила забота об исправлении нравов преступников или подсудимых. Эту должность занимали в основном те священники, которым консистория доверяла публичное чтение проповедей.19 июля 1813 года Иоанн Скобеев пожалован наперсным крестом на Георгиевской ленте «за пастырские наставления и убеждения крестьян вооружаться против неприятеля и содействие в истреблении онаго».
Надо отметить, что героев Отечественной войны в России всегда чтили особо, и прежде всего, конечно, самыми горячими почитателями своих земляков становились местные жители, на чьих глазах разворачивались те или иные события. Освобождение города Вереи прочно связывается с именем генерал-лейтенанта Ивана Семеновича Дорохова, под чьим командованием действовал и отряд Иоанна Скобеева.
Дорохов скончался 25 апреля 1815 года. Перед смертью он обращался к жителям Вереи с просьбой: «Если вы слыхали о генерале Дорохове, который освободил ваш город от врагов Отечества нашего, то я прошу вас за то в воздаяние, почтенные граждане, дать мне три аршина земли для вечного моего упокоения при той церкви, где я приступом взял укрепление неприятеля, истребив его наголову. Дети мои будут вам за то благодарны».
Память о подвигах генерала была настолько живой, что горожане встретили его останки за 30 верст, а потом пять верст несли на руках гроб с телом генерала до городского кремля, где он был с почестями захоронен в Рождественском соборе г. Верея. Панихиду по генералу отслужил его соратник, протоиерей Иван Скобеев.
Первый памятник генералу И.С. Дорохову. 1913 г.