31 августа 1829 года был пожалован наперсным крестом на Георгиевской ленте
К 1831 году отец Николай уже успел поучаствовать в сражениях при Вильно, Ковно, в штурме Варшавы, переправе через Неман, преследовании польских мятежников в Пруссии, переправе через Вислу, и только в 1834 году он возвратился в пределы Российской Империи.
В мирное время, в конце 1830-х годов между священниками 15-й пехотной дивизии и командирами полков дивизии возник раздор. Как выявил исследователь Вячеслав Михайлович Котков, старший священник Замосцкого полка Николай Самчевский обвинялся в «неспокойном характере», ослушании полковому командиру, а дивизионный благочинный священник Модлинского полка Мазюкевич – в поблажке отцу Самчевскому и некоторых нескромных выражениях о собственном военном начальстве. В деле разбирался обер-священник В.И. Кутневич.
Дознание показало, что поводом к обвинению, выдвигаемому против командиров, были неоднократные донесения Самчевского
Изучив множество документов по истории российского военного духовенства, мы можем констатировать: нам не известен ни один пример, когда в случае конфликта со священником был бы наказан командир полка. Этот раздор не стал исключением. Благочинный Мазюкевич получил взыскание обер-священника за резкие выражения в письменных отношениях с военным начальством, а Николай Самчевский в 1843 году был «по собственному желанию» уволен из Военного ведомства и переведен в Литовскую епархию.
Однако его битва с командирами, не соблюдавшими поста и «долга исповеди», не прошли даром. В Святейшем Синоде было инициировано рассмотрение вопроса о степени подчиненности полковых священников их воинским начальникам, а также
В результате появилась Резолюции Синода за № 14875 от 19 октября 1841 года, согласно которой