2 мая 1913 года состоялся суд, предметом разбирательства которого стало «Дело Стасовой и других». Вместе с Еленой Дмитриевной на скамье подсудимых сидели Арменуи Оввян, Вера Швейцер, Мария Вохмина и еще несколько человек. Главным пунктом обвинения было причастие этих людей к социал-демократической партии. На судебный процесс, проходивший в Тифлисе, приехали родители Стасовой. Дмитрию Васильевичу было очень тяжело видеть свою дочь среди обвиняемых. Один эпизод процесса Елена Дмитриевна привела в своей книге: «Председатель суда приглашал его (Дмитрия Васильевича Стасова —
Елену Дмитриевну отправили в ссылку в Енисейскую губернию на три года. Этап продолжался долго: из Тифлиса Стасова вместе с другими осужденными уехали 25 ноября 1913 года, а на конечный пункт, село Рыбное, прибыли 9 (22) января 1914 года. Путь следования лежал через Баку, Ростов, Козлов, Ряжск, Самару, Челябинск, Красноярск, Канск. Солдаты, сопровождавшие этап, урезали паек хлеба, ссыльные страдали от грязи и вшей. Но убежденность в том, что кардинальные перемены все-таки произойдут, поднимала дух осужденных.
Колония ссыльных (большевики, меньшевики, эсеры) в Енисейской губернии создала организацию взаимопомощи. Люди поддерживали друг друга не только морально, но и материально — путем небольших членских взносов.
Отдаленность от столицы не помешала Елене Дмитриевне вести переписку с партийными организаторами. Стасова верила в идеалы большевиков и делала все возможное для грядущей революции. В сентябре 1916 года Елена Дмитриевна добилась поездки в Петроград на четыре месяца. Она написала о поездке в родной город из Красноярска следующее: «Все вагоны третьего класса были переполнены солдатами-сибиряками, возвращавшимися из отпуска на фронт. (Шла первая мировая война —
Февраль 1917 – март 1920 гг. — период радикальных перемен в политической жизни России. Елена Дмитриевна работала секретарем ЦК партии. Участвовала в Февральской революции в подготовке и проведении Октябрьского вооруженного восстания.
В августе 1917 года состоялся VI съезд большевистской партии. На одном из заседаний председательствовал М. С. Ольминский. Он подозвал к себе Елену Дмитриевну и попросил ее уйти с заседания. Свою просьбу Ольминский разъяснил Стасовой: «А ты не знаешь, что мы заседаем нелегально, и что нас могут арестовать? Ты являешься "хранителем традиций" партии, а потому немедленно уходи».
Оппозиционная режиму, политическая деятельность конечно, была опасной. Важно было сосредоточить связи между членами и сторонниками партии, не дать порваться нитям союзничества и не обречь акции подпольных организаций на провал. Всем этим приходилось заниматься людям решительным, стойким, запоминающим все адреса, партийные клички, имена… Этим людям нужно было хранить традиции революционного движения. Такой «хранительницей» большевистская партия назначила Елену Дмитриевну Стасову.
В 1918 году, когда все руководство советского государства перебралось в Москву, Стасова осталась представителем новой власти в Петрограде.
У нее на это были и семейные причины. В то время тяжело болел ее отец, Дмитрий Васильевич. Елена Дмитриевна не могла бросить его даже ради исполнения своих партийных обязанностей. Горько переживала она смерть отца. Он был для нее кумиром, умным, талантливым, настоящим человеком, делающим все возможное для демократического будущего страны.
Тем временем контрреволюционное движение набирало силу. Необходимо было найти формы организации, которые боролись бы с противниками большевиков. Созданная в Петрограде ВЧК приняла меры по формированию Чрезвычайных комиссий в регионе. Следует отметить, что создание этих комиссии — закономерный этап становления советского государства. ВЧК стала первым специализированным органом госбезопасности. В июле – августе 1918 года состоялись губернские конференции чрезвычайных комиссий, принявшие нормативные документы для работы самостоятельных ЧК. (Раньше функции по борьбе с контрреволюцией выполняли отделы исполкомов). Кроме того, теперь комиссии располагали вооруженными силами: от отряда до полка.