В результате катастрофы погиб город Акротири на подвластной Кноссу Фере, а он был важным портом на трассах морских сообщений минойцев- Были разрушены поселения на Косе и Родосе, население существенно сократилось, и восстановленные города, вплоть до ахейских завоеваний, так и не достигли прежних размеров. Тем самым ослабели форпосты минойцев на пути в Восточное Средиземноморье.
Обнаружены следы пепла и значительных сейсмических разрушений в разных частях самого Крита. Это не могло не сопровождаться гибелью людей как непосредственно в результате катастрофы, так и от ее косвенных последствий. Вероятно, и основа могущества — минойский флот сильно пострадал от цунами. Разрушенный Кносский дворец так и не был восстановлен вплоть до вторжения ахейцев.
Продолжение в таких условиях прежней экспансионистской политики, содержание поселений и постов на обширной подвластной территории, не прекращавшаяся в течение десятилетий война с ахейцами-микенцами привели в конечном счете к истощению Минойской державы и определили исход войны в пользу ее противников. Их вторжение было жестоким и роковым для минойской цивилизации. Во всех дворцах и крупных поселениях Крита обнаружены следы разрушения, разгрома и пожара, датируемые 1470 —1450 годами до новой эры. На Крите утверждается господство ахейцев. Из всех разрушенных дворцов лишь Кносс был восстановлен и использовался новыми хозяевами. Это было завоевание, которому, по мнению некоторых исследователей, предшествовали внутренние раздоры, восстание угнетенного населения или сильное землетрясение. Смена власти была настолько существенной, что изменился даже язык дворцовых записей. Завоеватели пользовались линейным письмом В, которое, как выяснилось, явилось приспособлением прежней письменнести для передачи архаичного греческого (ахейского) языка.