Затем, убежав от кормилицы, Бенедикт прибыл в некое место, где пробыл три года. Никто не знал о нем, и только некий монах по имени Роман старательно доставлял Бенедикту все необходимое. От монастыря Романа нельзя было попасть к пещере, где жил Бенедикт, поэтому Роман привязывал хлеб на длинную веревку и так спускал его. К этой веревке он приладил бубенец, чтобы по его звуку Божественный муж узнавал, когда Роман приносит хлеб, и, выйдя, принимал его. Но древний враг, завидуя любви одного и отдохновению другого, метнул камень и сломал бубенец. Однако Роман не переставал приносить хлеб.
В то время некий пресвитер приготовлял себе пасхальную трапезу, В видении ему явился Господь, говоря: «Ты готовишь для себя роскошные яства, а раб мой в таком-то месте страдает от голода». Пресвитер тотчас встал и отправился на поиски Бенедикта. Найдя его с великим трудом, он сказал: «Восстань, и вкусим от яств, ибо сегодня Пасха Господня». Бенедикт же ответил ему: «Знаю, что Пасха, ибо я удостоился видеть тебя». Ведь, находясь вдали от людей, он не знал, что на этот день выпало торжество Пасхи. Пресвитер же сказал: «Воистину, сегодня — день Воскресения Господня, и не подобает тебе воздерживаться от пищи — для того я и послан к тебе». Так, благословляя Бога, они вкусили пищу.
Однажды черная птица, называемая дроздом, стала дерзко летать у самого лица Бенедикта, так что он мог поймать ее рукой. Но, сотворив крестное знаменье, святой отогнал птицу. Тотчас диавол представил перед его умственным взором женщину, которую Бенедикт некогда видел. Ее образ разжег его душу таким огнем, что, побежденный похотью, он почти уже решился покинуть пустыню. Но по Божественной благодати Бенедикт внезапно пришел в себя, тотчас снял одежды и стал кататься в зарослях терновника, который там рос. Когда он вышел, все тело его было изранено, но ранами на коже он исцелил раны в душе. Так Бенедикт победил грех, угасив пламя страстей, и с тех пор в его теле больше не возникало никаких искушений.
Слава Бенедикта возрастала. И вот однажды скончался аббат некоего монастыря. Вся братия этого монастыря пришла к Бенедикту и просила возглавить их обитель. Он долго отказывался, предсказывая им, что не сможет ужиться с нравами братии, но, наконец, побежденный, дал согласие Когда же он приказал строго соблюдать устав, монахи стали корить себя самих за то, что попросили его стать аббатом. Ведь их нечестие оскорбляло праведность Бенедикта. Когда же монахи поняли, что под его властью им запрещено творить недозволенное, но им тяжко оставить привычное, они подмешали яд в вино и подали его Бенедикту перед сном. Он же сотворил крестное знамение и как бы ударом разбил тот стеклянный сосуд. Поняв, что это было питие смерти, ибо оно не вынесло знамения жизни, Бенедикт тотчас встал и с ясным лицом сказал: «Да помилует вас всемогущий Бог, братья! Не говорил ли я вам, что не смогу ужиться с вашими нравами».
Тогда он ушел в заброшенное место в пустыне и просиял там многими знамениями, а для тех, кто приходил к нему, построил двенадцать монастырей. В одном из них был монах, который не мог долго стоять на молитве. Когда другие молились, он тотчас выходил вон и занимался вещами мирскими и преходящими. Аббат монастыря рассказал об этом блаженному Бенедикту. Он пришел туда и увидел, как того монаха, который не мог находиться на молитве, за полы одежды тащил вон какой-то черный младенец. Бенедикт сказал аббату монастыря и монаху Мавру: «Разве вы не видите, кто его тянет»? Они же ответили: «Нет». Тогда он сказал: «Помолимся же, чтобы и вы увидели». Во время молитвы Мавр увидел, но аббат так и не смог. На другой день, по окончании молитв, Божественный муж встретил того монаха у дверей и ударил посохом за его слепоту. С тех пор на молитве он был неподвижен, а древний враг не дерзал властвовать над его мыслями, как будто сам был поражен тем ударом.
Из этих двенадцати монастырей три находились высоко на гордых уступах, поэтому монахи доставляли снизу воду с большим трудом, братья часто просили Божественного мужа переселить их в другое место, Однажды ночью Бенедикт вместе с неким отроком поднялся на гору, где долго молился, а затем сложил знак из трех камней, составленных вместе. Затем он вернулся домой. Когда утром братья снова пришли к нему с той же просьбой, Бенедикт сказал: «Ступайте и найдите гору, на которой три камня сложены вместе; затем начните копать там, ибо Господь силен извести оттуда воду. Они пошли и увидели эту гору, из которой уже сочилась вода. Сделав в том месте углубление, монахи увидели, как оно тотчас заполнилось водой. Вода течет оттуда до сих пор, да так изобильно, что поток нисходит от вершины горы вплоть до самых низин.
Однажды около монастыря, где жил Божественный муж, некто среза терновник садовым ножом, но лезвие, соскочив с рукояти, упало в глубокое озеро. Тот человек опечалился, но Бенедикт опустил рукоять в озеро, и лезвие тотчас всплыло к своей рукояти.