15 августа 1918 года Кемаль-паша вернулся в Халеб в должности командующего 7-й армией. После подписания Мудросского перемирия 30 октября 1918 года он был назначен на пост командующего группой армий «Йылдырым», а после ее демобилизации вернулся в Стамбул в министерство обороны. 19 мая 1919 года Кемаль-паша в качестве инспектора 9-й армии прибыл в Самсун, а уже 22 июня 1919 года в Амасье обнародовал циркуляр о том, что независимость страны находится под угрозой, и объявил созыв депутатов на Сивасский конгресс. 8 июля 1919 года Кемаль ушел в отставку. 23 июля – 7 августа 1919 года в Эрзуруме состоялся съезд шести восточных вилайетов империи, за которым последовал Сивасский конгресс с 4 по 11 сентября 1919 года. 3 сентября 1919 года султанское правительство издало указ об аресте Мустафы Кемаля-паши, но войска в Малой Азии отказались его выполнять. Кемаль созвал в Ангоре собственный парламент – Великое национальное собрание Турции (ВНСТ), первое заседание которого открылось 23 апреля 1920 года. Кемаль был избран председателем парламента и главой правительства Великого национального собрания, которое тогда не признавалось ни одной из держав. 29 апреля ВСНТ приняло закон, приговаривающий к смертной казни любого, кто усомнится в его легитимности. Кемаль возглавил турецкую армию в Малой Азии, которая нанесла поражения армянам и грекам. 7 июня 1920 года ангорское правительство объявило недействительными все прежние договоры Османской империи, а также отвергло подписанный 10 августа 1920 года между султанским правительством и странами Антанты Севрский договор, отдававший значительную часть территории Малой Азии и Восточную Фракию Греции, а Западную Армению – Армении. Греческая армия потерпела поражение в битве при Сакарье (23 августа—13 сентября 1921 года). После победы при Сакарье ВНСТ 21 сентября 1921 года пожаловало Мустафе Кемалю титул «гази» и звание маршала. Окончательно греческие войска были разгромлены при Домлупынаре, после чего их остатки вместе со значительной частью греческого населения покинули Малую Азию.
2 ноября 1922 года ВСНТ упразднило султанат, а в 1924 году – халифат. 29 октября 1923 года была провозглашена республика с Кемалем в качестве её президента. Фактически ему принадлежала вся полнота власти в стране. Кемаль провел ряд реформ, европеизировав турецкое общество. В соответствии с Законом о фамилиях 24 ноября 1934 года ВНСТ присвоило Мустафе Кемалю фамилию Ататюрк.
В секретном донесении британского генерала Чарльза Харрингтона (1872–1940), главы оккупационной армии в Турции, от 20 января 1921 года, направленном в британское министерство обороны, отмечается, что в 1907 году Кемаль-паша вступил в итальянскую масонскую ложу «Macedonia resorta et Veritas» («Восставшая Македония и истина»), а также в партию «Единение и прогресс». На одном из собраний ложи «Macedonia resorta et Veritas» Ататюрк был зарегистрирован под № 196, однако участия в других собраниях не принял. Слуга Ататюрка Джемаль Гранда в своей книге «Я был слугой Ататюрка» и в интервью от 17 сентября 1970 года заявил о том, что лично слышал из уст Мустафы Кемаля, что тот имел практику посещения масонской ложи. В Измире в отеле «Наим палас» в беседе с ним Ататюрк упомянул следующее: «Знаете, я тоже был масоном. Как-то с товарищами мы прогуливались. Взяв меня под руки, они повели меня в ложу, мимо которой мы проходили. Как я помню, мы спустились по мраморной лестнице. Перед нами оказался какой-то зал. Там нас усадили за стол, угостили чаем. Мы опять встали, спустились по лестнице, снова попали в какой-то зал. Там было очень людно. Группа людей исполняла некую церемонию с мечами. Я ничего не понимал из того, что видел. Знали мои товарищи. Они сказали мне смотреть. Мы прошли через людей с мечами. Положили руку на книгу. Потом вышли наружу. После того я более никого из них не видел, не говорил и не ходил в то здание. Но до сих пор не могу выйти из него». Очевидно, Кемаль-паша был посвящен в низшую степень ученика, но активного участия в деятельности ложе не принимал. Из лидеров младотурецкой партии «Единение и прогресс» несомненно масонство одного из лидеров младотурок Мехмеда Талаата-паши, члена масонской ложу «Македония Ризорта» и основателя стамбульской ложи «Хюр ве Кабул Эдильмиш», где одно время даже был великим магистром.
Тем не менее до 1935 года масоны чувствовали себя в Турции довольно вольготно. В 1932 году масонские ложи 25 стран хотели провести свое собрание в Турции (неизвестно, состоялось ли оно). Однако принадлежность к масонам не помешала Ататюрку в 1935 году приостановить деятельность всех масонских лож в Турции, сделав их «спящими». Вероятно, тяжелобольной Ататюрк опасался, что масоны могут встать в оппозицию к его преемнику.