С 1922 по 1939 г. монастырь находился на территории Польши и вместе со всей Виленской епархией был в составе Польской православной церкви. В пределах послевоенного СССР обитель не только осталась открытой, но и благоустроилась. 13 июля 1946 г. состоялось торжественное возвращение мощей святых виленских мучеников в монастырь, где с тех пор этот день торжественно отмечается. В 1982 г. восстановлен и освящен придел во имя апостола Иоанна Богослова в главном храме, тогда же был оборудован лифт на колокольне, а также благоустроен братский корпус.
После распада СССР, при митрополите Виленском Хризостоме, соборный храм Святого Духа был основательно обновлен. В 1996–1997 гг. произвели капитальный ремонт перекрытий пола главного храма, деревянные балки заменили металлическими, а пол выложили керамическими плитками. Одновременно расширили пещерную церковь и сделали к ней два входа. Внутри и снаружи церковного здания провели косметический ремонт. В июле 1997 г. отмечался 400-летний юбилей монастыря и 650-летие со времени убиения виленских мучеников. В 1993 г. в Свято-Духовом монастыре открыта общедоступная библиотека духовной литературы, насчитывавшая ко второй половине 2000-х гг. около 13 000 томов. На территории монастыря в заново отстроенном здании разместилось управление Виленской епархии, резиденция правящего архиерея, священноархимандрита Свято-Духова монастыря.
65. Виленский Свято-Троицкий необщежительный мужской монастырь
3-го класса (с 1845 г.) в самом городе, близ Острой брамы (или Острых ворот).Время основания его неизвестно с точностью (Троицкий храм был выстроен при литовском великом князе Ольгерде в середине XIV в., на месте мучения свв. Антония, Иоанна и Евстафия); существовал уже в 1490 г.; в 1514 г. храм представлял развалины и был возобновлен князем Константином Острожским; в 1584 г. при монастыре образовалось Свято-Троицкое братство, имевшее свою типографию, училище и богадельню; в 1609 г. монастырь был обращен в униатский; в 1839 г. поступил в православное ведомство; в 1845 г. в него была переведена духовная семинария из местечка Жировиц (Гродненская губерния). С тех пор настоятелями монастыря становятся архимандриты – ректоры семинарии.
Храм один каменный во имя Св. Троицы, с приделом во имя св. Иоанна Богослова (устроен в 1896 г.). В храме имеется местночтимая Виленская икона Божией Матери (принесенная в Вильну великой княгиней Литовской Еленой Ивановной, дочерью великого князя Московского Иоанна III в 1495 г.).
Монастырь получает из казны 1840 руб. и от оброчных статей 1313 руб. в год.
Архимандрит, монахов 7, послушников 9.
66. Архиерейский дом.
В самом городе.67. Загородный архиерейский дом
в Тринополе, в 3 в. от города Вильны, при р. Вилии. Приписан к архиерейскому дому в 1146 г.Храмов каменных два:
1) домовый;
2) кладбищенский в честь Успения Божией Матери (построен в 1850 г.). Земли имеется 2,31 дес. усадебной, 6,49 дес. огородной, 162,51 дес. пахотной, 9,62 дес. сенокосной, 108,5 дес. под лесом и 88, 61 дес. неудобной.