Армянское духовенство держат под строгим контролем. Наконец, 12 июня 1903 года царское правительство объявляет о конфискации имущества Армянской церкви. Эта последняя мера вызывает бурю негодования и серию выступлений армянских общин против деспотии самодержавия. Католикос Айрик Хримян, отважно противостоящий конфискации, тщетно добивается приема у царя. Население армянских деревень и городов стремится защитить церкви от поругания. В Эчмиадзине католикос отказывается передать ключи от казны чиновникам из Москвы, и русские войска, выломав двери, врываются в собор св. Григория.
Армянская буржуазия и интеллигенция в едином порыве объединяются для поддержки национальной Церкви. Активные революционеры и убежденные атеисты встают рядом с верующими на защиту храмов и монастырей. Армянские политические партии переходят в наступление на царское правительство, организуя забастовки и демонстрации. 14 октября 1904 года в Тифлисе трое молодых членов партии Гнчак совершают покушение на князя Голицына. Затем совершается ряд террористических актов против царских чиновников. С 1904 года на смену террористам из партии Гнчак приходят дашнаки.
Русские революции и первая мировая война
Защита прав армянского народа в России и за ее пределами все очевиднее приобретает форму борьбы с самодержавием и реализуется в одном русле с разными социалистическими и революционными движениями той эпохи. В Армении в начале века начинают распространяться марксистские идеи. В числе первых сподвижников Ленина мы видим Степана Шаумяна, который в 1904 году перевел на армянский язык
После неудачной войны с Японией в 1904 году российская политическая жизнь стала более напряженной. Кризис усилился после «кровавого воскресенья» 9/22 января, когда царские войска стреляли в Петербурге по 100-тысячной толпе демонстрантов. События переросли в настоящую революцию, вылившуюся в стачки, восстания, акты террора. Одним из последствий революции 1905 года стало обострение этнической борьбы, которая подспудно шла уже давно.
В 1905 году царское правительство в ответ на демонстрации дашнаков спровоцировало первые армянские погромы в Баку. 19, 20 и 21 февраля банды азербайджанцев, подстрекаемые русскими властями, стали истреблять армянское население. Перед лицом бездействия войск и русской полиции армяне сами организуют свою оборону. В Баку, Ереване, Шуши, Тифлисе, Нахичеване и по всей империи они устраивают жестокие акции возмездия азербайджанцам. Так, за армянскими погромами в Баку в течение всего 1905 и 1906 годов следует серия террористических актов, совершаемых армянами: это так называемые «Армяно-татарские войны» — ожесточенный конфликт между армянами и азербайджанцами (тогда они называли себя кавказскими татарами).
В период с 1905 по 1915 годы преемник Голицына наместник на Кавказе князь Воронцов-Дашков восстанавливает порядок: он кладет конец имперской антиармянской политике, снова разрешает открывать школы и возвращает имущество Церкви.
Но в 1906 году в Петербурге министром внутренних дел и председателем Совета министров становится реформатор и одновременно реакционер П. А. Столыпин. Борясь с терроризмом, он тоже начинает вести политику насильственной русификации. Кроме того, он вводит военно-полевые суды, которые в кратчайшие сроки приговаривают к смерти сотни революционеров. Ужас перед массовыми приговорами этих судов такой, что оставляет след даже в русском языке в форме эвфемизма того времени —
В декабре 1908 года начинаются аресты армянских патриотов, которых считают экстремистами; арестовывают более 2000 человек. В 1912 году разворачивается громкий судебный процесс против 400 дашнаков, которых защищают лучшие российские адвокаты Керенский и Милюков. С этого момента партия дашнаков в России объявляется вне закона. А в Турции она вступает в контакт с другими оппозиционными или находящимися в изгнании партиями, в частности, с младотурками.
Между тем вспыхивает первая мировая война, в которой Германская и Австро-Венгерская империи и их союзники (в том числе Турция) противостоят Антанте, включавшей в себя Францию, Англию и Россию. Многие армяне как подданные царской империи призваны в российскую армию и в ее составе сражаются на западном фронте Европы. Однако, как мы уже говорили, формировались и добровольческие отряды, которые служили проводниками для русских солдат в горах Западной Армении, занятой турками. Мы видели, что успех русских в начале войны был значительным. Оставленный в июле 1915 года, Ван снова занят уже в сентябре. В первой половине 1916 года русские берут Эрзерум, Битлис, Трапезунд (ныне Трабзон), освобождая таким образом большую часть исторической Армении.