Социальный состав скопческой секты серьезно отличался от состава секты хлыстов. Причем в более радикальной секте собралось общество побогаче — купцы, зажиточные крестьяне, промышленники. Это отразилось и на идеологии. Так, скопцы всегда почтительно относились к царской власти. Более того, богатые скопцы даже делали пожертвования в пользу православной церкви, от учения которой отошли очень далеко. Известно, что митрополит Филарет относился к последователям Селиванова лучше, чем к любым другим сектантам.
Отношение же российских властей к секте было сложным. Как уже было сказано, в 1772 г. было проведено первое дело по поводу скопцов, в ходе которого были арестованы и сосланы в Сибирь руководители секты. В 1807 г. Священный Синод признал секту наиболее опасной и вредной сектой России, а в 1835 г. уже и Сенат определил скопцов как врагов человечества, разрушителей морали, преступников, нарушающих божественные и гражданские законы.
Однако в первой половине XIX века секта неуклонно росла. Скопцы гораздо активнее, чем хлысты, работали над привлечением в свои ряды «новиков» (новичков). При этом к собственно оскоплению человека подводили очень осторожно, давали «влиться в коллектив», ощутить атмосферу радений, бомбардировали выдержками из религиозных текстов. Операцию производил, как правило, приглашенный издалека сектант. Оскопленный не должен был знать его имени и не должен был встречаться со своим палачом впоследствии.
Рост секты был вызван и чисто экономическими причинами. Оказалось, что держать на предприятии общину скопцов очень выгодно. Оскопленные рабочие были менее агрессивны, нетребовательны, держались товарищей по уродству. Всю заботу о членах общины брало на себя ее руководство (как правило, владелец предприятии), оно же осуществляло полный контроль над жизнью рядовых сектантов. Купцы и мануфактурщики, ставшие скопческими наставниками, за несколько лет получали огромные барыши. По всей видимости, сам Селиванов в преклонном возрасте управлял из своего столичного особняка настоящей промышленной корпорацией.
К 1826 г. количество скопцов в России достигло 10–15 тысяч человек. По настоянию Православной церкви и жандармерии Николай I повелел производить массовые аресты и высылки скопцов в Сибирь. Годных по здоровью сектантов зачислили в солдаты и отправили воевать на Кавказ. Секта была запрещена и предана проклятию.
Однако и в Западной Сибири вербовка последователей скопчества продолжалась. В 1848 г. власти изменили место ссылок на Якутию и Забайкалье. Действительно, в Якутии скопцам не удалось привлечь достаточно новых последователей. Есть сведения, что якутским чиновникам удалось заключить с руководителями секты своеобразное соглашение. Скопцов не отправляли на поселение в самые глухие места тундры, а те, в свою очередь, отказывались от усиления своего религиозного влияния. Сектанты были поселены на наиболее плодородных землях. Попытки проведения радений безжалостно пресекались полицией, и скопцы переключились на ведение хозяйства. В этом деле они достигли больших успехов. Скопцы выращивали тыквы, рожь и пшеницу, разводили птицу, усиленно торговали. Предприимчивость и дисциплина позволила скопцам занять ведущие позиции на якутском рынке сельскохозяйственной продукции. Известно, например, что в 1888 г. им удалось скупить на подъездах к Якутску весь хлеб у окрестных крестьян, после чего втридорога перепродать его в городе. Экономические успехи были, по всей видимости, связаны и с образом жизни скопцов. Они славились своим скромным поведением — развлечения, вино и драки скопцов не интересовали.
Во второй половине XIX века рост секты прекращается. Намечается отход от традиционных правил и принципов. Оскопление все чаще становится «духовным». Многие скопцы были вынуждены покинуть Россию и поселиться в Румынии. Согласно документам Министерства внутренних дел, в 60—70-х годах секта уже не представляла какой-либо серьезной опасности для государственного строя. Однако в тех же документах отмечается значительный капитал, накопленный руководителями скопческих общин.
Последняя вспышка изуверского сектантства относится к началу 70-х годов XIX столетия. В это время в Молдавии и Крыму появляются новые скопческие общины. Во главе обновленного движения становится совет из 40 членов — «святое избрание». Новым искупителем стал портной Кузьма Лысин. Проповедники, разосланные по всей России, утверждали, что вскоре Лысин прибудет в Петербург, царь узнает его, посадит по правую руку от себя и освободит всех скопцов. Вместо этого в 1876 г. Лысин предстал перед судом и был приговорен к каторжным работам.
Советская власть боролась со скопчеством еще более последовательно, чем царское правительство. В начале 1929 г. были раскрыты общины в Ленинграде, Москве, Саратове, на Дону. Столичные общины базировались на фабриках. В частности, скопцам было предъявлено в принципе справедливое обвинение в монархических настроениях. Действительно, скопцы долго хранили царские портреты, флаги с надписями «Боже, царя храни» и т. д.