Старейшее упоминание об афонских монахах относится к середине IX в. К концу того века на Афоне образовались монашеские колонии, так называемые «лавры». К этому же периоду относятся и грамоты византийских императоров, которыми монашеской общине Афона была предоставлена автономия. Поворотный пункт в жизни Афона ознаменовало собой создание в 963 г. первого «настоящего» монастыря – лавры Св. Афанасия, основанной византийским монахом Афанасием. Вскоре на Афоне были созданы еще два монастыря – грузинский Ивирон и греческий Ватопед. В целом же монастырский комплекс Афона сложился в X–XI вв., со временем включив в себя греческие, грузинские, болгарские, русские, сербские и румынские (молдавские и валахские) общины.
Постепенно на Афоне выработался строй, который с более или менее значительными изменениями сохранился до настоящего времени. Основными единицами общины являются монастыри, обладающие самостоятельностью, имеющие каждый свой устав и пользующиеся равными правами. Им подведомственны и монахи, живущие вне монастырей (так называемые келиоты). Афонскую общину возглавляет Св. кинот – собрание, возглавляемое протосом, в состав которого входит по одному представителю от каждого монастыря. Кинот в свою очередь ежегодно избирает совет – Эпистасию, который является органом исполнительной власти на полуострове. В состав Эпистасии избирается поочередно по одному представителю от каждых пяти монастырей.
Эта необычайная «монашеская республика», и сегодня пользующаяся формальной автономией в составе греческого государства, на протяжении многих веков являлась центром монастырской жизни в Восточной Европе. Рост авторитет Афона в Средние века во многом был связан с ролью его монахов в духовной жизни Византии. Важное значение Афону придавали и прямые связи, которые поддерживались им с византийской столицей.
В Средние века афонским монастырям делали щедрые пожертвования византийские, болгарские и сербские правители. Значительные привилегии Афон сохранял и во времена османского ига, являясь автономным христианским анклавом в мусульманской Турции. Благодаря этому на Афоне удалось спасти многие духовные ценности порабощенных турками балканских народов. Среди богатейших культурных сокровищ Св. горы – иконы, миниатюры, художественная резьба, изделия из камня, металла и кости. В монастырских библиотеках хранится свыше 10 тысяч греческих, славянских и других рукописей, в т. ч. грамоты византийских императоров, болгарских, сербских и русских царей. Обширные и разнообразные культурные богатства Афона остаются все еще малоизученными.
Сегодня к числу афонских монастырей принадлежат Великая лавра Св. Афанасия, греческие монастыри Ватопедский, Дионисиу, Кутлумуш, Пантократора (Вседержителя), Ксиропотамос, Дохиариу, Каракалу, Филотеу, Симонопетра, Св. Павла, Ставроникита, Ксенофонтов, Грегориу, Эсфигмену, Кастамониту; грузинский Иверский монастырь (Мони-Ивирон, X в.), сербский Хиландарский монастырь (XII в.); болгарский Зографский монастырь (XI–XIII вв.); русский монастырь Св. Пантелеймона (XII в.). Большинство монастырей Афона расположено вдоль скалистых берегов полуострова, и только некоторые – вдали от моря. В эпоху Средневековья монастыри должны были быть защищены от морских пиратов и от различных мародеров, поэтому в стенах монастырей делали только один вход – с железными воротами, открывавшимися с восходом солнца и закрывавшимися с заходом.
Архитектура храмов Афона отличается подчеркнутой монументальностью. Для них характерен тип так называемого триконха – трилистника. Афонские церкви всегда одноглавые и с западной стороны имеют широкую крытую паперть, где во время богослужения могут располагаться многочисленные послушники монастыря и паломники.
Административным центром Афона является Карея – небольшой монашеский городок, расположенный в самом центре полуострова, на северо-восточном склоне Св. Горы. Здесь располагается Протатон – местонахождение органов самоуправления «монашеской республики», а также подворья всех афонских монастырей, почта, телеграф, таможенное и полицейское управления, магазины, медицинский пункт и т. п.
Главный храм Протатона, посвященный Успению Пресвятой Богородицы, представляет собой трехнефную базилику с внешней галереей на северной стороне. Высокая прямоугольная колокольня сооружена в нескольких метрах от северо-восточного угла церкви. По преданию, храм был основан еще в 335 г. императором Константином Великим. Сгоревший во время большого пожара, он был восстановлен в X в. византийским императором Никифором Фокой. Храм украшен замечательными фресками начала XIV в., относящимися к так называемой «македонской школе». Эти фрески, близкие к произведениям монументальной живописи Салоник, являются блестящим примером византийского искусства Палеологовского периода. Среди них особенно выделяется сцена «Введение Богоматери во храм»