В случае необходимости иметь на борту переходящего по Севморпути судна «спецпассажиров», которых надо незаметно доставить куда-то в Арктику, скрыть их от советских лоцманов на борту «Иллера» было бы невозможно (не говоря о сложностях с их размещением на корабле. —
Практика подобной доставки нацистских «специалистов» в Арктику былахорошо отработана германской разведкой еще в июне 1939 года, когда такие группы, обычно называемые «научными сотрудниками ленинградского Арктического института», приходили на наших судах в Карское море. Были ли среди них офицеры фашистской военно-морской разведки, гадать не стоит, так как обычно этих «исследователей» высаживали на островах архипелага Норден-шельда и шхер Минина, то есть именно там, где в военные годы наиболее уверенно и активно действовали подводные «волчьи стаи» Деница. К сожалению, только после окончания войны наши компетентные органы обратили внимание на то, что места высадки этих «научных» групп почти всегда совпадали с теми районами, которые германские специалисты начали тщательно изучать еще в 1931 году во время полета дирижабля «Граф Цеппелин».
Из вышесказанного следует достаточно печальный вывод — районы скрытного базирования «волчьих стай» в Карском море немцы основательно готовили еще задолго до начала войны с СССР.
Далее все проходило с чисто немецкой педантичностью, действительно, как по мановению волшебной палочки: из списков торговых судов Третьего рейха навсегда исчезает «Эмс», а у одного из причалов гамбургского судостроительного завода «Ховальдтсверке» в декабре 1939 года встало на переоборудование некое «Судно № 45».
В весьма сжатые сроки немецкие судоремонтники сумели из простой железной коробки, обычного транспорта, соорудить первоклассный рейдер, предназначенный не только для активной охоты за вражескими судами в различных районах Мирового океана, но и для ведения разносторонней разведывательной деятельности на море (кстати, последнее стало известно только после окончания войны). Все работы по переоборудованию были закончены в июне 1940 года, и бывший «Эмс» перешел в некогда польский порт Гдыня, который после сентября 1939 года был переименован немцами в порт Готенхафен.
Но это уже был совершенно другой корабль, так как в процессе переоборудования на борту «Судна № 45» было установлено шесть торпедных аппаратов, шесть 150-миллиметровых орудий ЭКГ/45 и шесть зенитных орудий и автоматов ЭКГ/83 и ЭКГ/66. Все это хозяйство было искусно замаскировано и укрыто специальными откидными щитами. Здесь же, на верфи, было изготовлено много приспособлений, позволявших существенно изменять силуэт рейдера за счет изменения высоты матч, формы и высоты дымовой трубы, количества и высоты грузовых стрел. Все это имущество использовалось на «Судне № 45», чтобы океанский оборотень мог многократно менять свое обличье и даже силуэт. Не удивительно, что новый морской разбойник выглядел волне мирным торговым судном. В специально сооруженном судовом ангаре был укрыт гидросамолет типа «Арадо-196А1», который позволял рейдеру вести дальнюю разведку в море, в том числе и ледовую. На борту также имелся специальный быстроходный катер, предназначавшийся для скрытного минирования вражеских акваторий. Его эхолот и гирокомпас во многих отношениях превосходили по своей точности приборы, установленные на наших судах.
Официально в состав Кригсмарине новый рейдер был включен 2 июня 1940 года. В этот день он находился у причала внутренней гавани порта Готенхафен.
Порт Готенхафен расположен в средней части Гданьского залива (Балтийское море), до сентября 1939 года принадлежал Польше и именовался портом Гдыня. После окончания Второй мировой войны вновь был переименован в Гдыню.
Поданным на июль 1940 года, он состоял из трех частей: военной, внешней и внутренней гаваней. Военная гавань, имеющая глубину 8 метров, представляла собой небольшой бассейн в северном углу внешней гавани у северного мола. Она могла обслуживать легкие силы (лидеры, эскадренные миноносцы и подводные лодки); для легких крейсеров вход возможен, но стоянка слишком тесна.
Торговый порт состоял из внешней и внутренней гаваней. К внутренней гавани проложен портовый канал, у западного конца которого построен большой судостроительный завод.