В июле 1918 г. "Кавати" выполнял различные учебные задачи совместно с флагманом 1-го флота линкором "Ямасиро". Вечером 11 июля "Кавати" вошел в залив Токуяма в префектуре Ямагути. Перед рассветом 12 июля экипаж подготовил для буксировки мишень для торпедных стрельб, но из-за плохой погоды стрельбы были отменены, и экипаж занялся рутинной службой. В 15:51 в районе погреба носовой башни с правого борта раздался звук, похожий на взрыв пороха. Почти сразу корабль сотряс огромный взрыв, сопровождаемый столбом желтого дыма, вырывающимся между первой и второй трубами, коричневым дымом из дымовых труб и горячими газами из отверстий на верхней палубе. Через две минуты линкор стал быстро крениться на правый борт и еще через две минуты перевернулся. Корабль сел надстройками на дно залива так, что на поверхности осталась небольшая часть днища (боковой киль левого борта, один винт и половина руля). Хотя и были отданы приказы на контрзатопления, спасти корабль не представлялось возможным. Удалось спастись 433 членам экипажа, причем некоторые сумели выбраться на поверхность через 4 часа после взрыва. Прибывшие на место катастрофы спасатели еще слышали стуки внутри корпуса на следующий день после трагедии, но больше никого спасти не удалось - 618 человек погибли или пропали без вести в результате взрыва.
Гибель "Кавати" через полтора года после взрыва линейного крейсера "Цукуба" шокировала японский флот. Морское министерство сразу приняло решение об образовании комитета для выяснения причин катастрофы под руководством адмирала Мураками Какуити. Комитет предположил, что причиной взрыва могло быть самопроизвольное разложение пороха, треть из которого имела возраст от пяти до семи лет. Однако пороховые заряды орудий главного калибра были обследованы на предмет их стабильности за полгода до катастрофы, и комитет не нашел никаких доказательств этой версии. Весьма тщательно рассматривалась и версия поджога, поскольку считалось, что в предшествующих взрывах на "Микасе", "Мацусиме" и "Цукубе" виноват человеческий фактор. Розыскные мероприятия по проверке этой версии проводились в 25 префектурах. Полиция допросила не только членов экипажа, но и их семьи, а также просмотрела большое количество писем уцелевших членов экипажа. В первую очередь под подозрение попал обслуживающий персонал погреба носовой башни главного калибра, большей частью отсутствовавший на борту во время взрыва. Их неоднократно проверяли на благонадежность и вели длительную слежку, но никаких свидетельств диверсии также не было обнаружено. В результате своей работы для предотвращения подобных происшествий комитет предложил набор мер по контролю качества зарядов, условиям их хранения и оборудованию пороховых погребов, установлению процедур доступа в погреба, исключающих проникновение лицам, не имеющим допуска, а также разъяснительную работу с обслуживающим погреба персоналом.
18 июля Морское министерство приступило к обследованию корпуса, и 6 августа было представлено заключение, указывающее на нецелесообразность подъема и восстановления корабля. Стоимость работ была оценена более чем в половину стоимости первоначальной постройки и должна была задержать строительство одного из кораблей программы "8-8" более чем на год. Поэтому Морское министерство приняло решение разобрать корабль. 11 сентября "Кавати" был приписан к Куре, а 21 сентября 1918 г. исключен из списков кораблей японского Императорского флота. Рабочие с верфи ВМС Куре частично разобрали остов, но большая его часть была оставлена на месте катастрофы.
23 июля 1918 г. "Сетцу" был включен в состав 1-й дивизии 1-го флота, а 20 августа вновь переведен во 2-ю дивизию. 9 октября началось переоборудование линкора в Императорский инспекционный корабль, и 28 октября император Тайсе с борта "Сэтцу" принимал 10-й военно-морской парад в Йокогаме, посвященный победе в Первой мировой войне. 9 июля 1919 г. линкор принимал участие в очередном, 11-м военно-морском параде в Йокосуке. К этому времени самый старый дредноут японского флота нуждался в ремонте и 3 ноября 1919 г. был переведен в 3-й резерв. Ремонт "Сэтцу" на верфи ВМС Куре занял больше года - с 1 апреля 1920 г. по 31 августа 1921 г.. В это время была, в частности, заменена часть котлов. 10 сентября линкор был переведен в 1-й резерв, а 10 октября переклассифицирован в учебный корабль.