В армии началась реформа, не содержавшая в себе модернизацию, а сводившаяся к простому сокращению людей и техники (сокращение численности войск и количества частей, снятие с вооружения «неперспективной» техники). ВВС, особенно истребительная авиация, оказались в состоянии тяжелого кризиса. Советники новой власти предлагали вообще отказаться от авиации, а защиту неба Сербии поручить Венгрии. До такого не дошло, в первую очередь, из-за выступлений СМИ, но также потому, что непрочность ситуации в Косово привела к оживлению связей между Белградом и Москвой.
ВВС стали постепенно «расправлять крылья». После разделения Югославии на Сербию и Черногорию, Сербии отошла большая часть «общей» авиационной техники. Огромным успехом стало обновление ремонтного завода «Мома». За счет ремонта и модернизации, которые проводились не только в Сербии но и в России и Белоруссии, постепенно увеличивалось количество боеготовой техники. В настоящее время в ВВС и ПВО имеется около ТОО самолетов (из них 80 боевых) и 60 вертолетов.
Основными задачами ВВС и ПВО Сербии являются: контроль воздушного пространства, отражение агрессии со стороны ВВС других стран и предотвращение нежелательных инцидентов, ПВО территории и вооруженных сил, непосредственная авиационная поддержка сухопутных войск, воздушная разведка, участие в ликвидации последствий природных катастроф, участие в международных миротворческих операциях.
Дислоцированному в Земуне штабу ВВС и ПВО подчиняются 204-я и 98-я авиационные бригады, 250-я ракетная бригады, бригада BOJHH (воздушно осматранье, jавгьанье и навоенье; воздушное наблюдение, оповещение и управление), 333-й инженерный батальон, 210-й батальон связи, авиационно-медицинский институт, ремонтный завод «Мома Станойлович и музей военной авиации. С 2011 г. в ВВС и ПВО Сербии служат летчики-женщины – Сандра Радованович и Анна Тадич, пилоты «Супергалеб» из истребительно-бомбардировочной эскадрильи, а также первая женщина – пилот вертолета «Газель» Аня Крнета.
В августе 2010 г. ВВС и ПВО получили два Ми-17В, которые стали первыми за 18 лет «строго поста» новыми летательными аппаратами, «пост» продолжался с 1992 г., когда были получены последние новые «Супергалеб» и «Орао». В конце 2010 г. был закуплен и первый за долгие годы новый самолет – Пайпер «Сенека V», предназначенный для аэрофотосъемки. Начали поступать на вооружение учебные поршневые самолеты Ласта-95. Проводится модернизация ЗРК «Нева» до уровня С-125М1Т – ЗРК оснащаются тепловизионным каналом наведения. Аналогичным образом до уровня М2 модернизируются ЗРК «Куб-М».
После выхода из состава Югославии Черногории, Сербия осталась без адекватного морского полигона, где можно было производить практические пуски ракет ЗРК «Нева» и «Куб». Первые за 21 год пуски ракет ЗРК «Куб» были выполнены в сентябре 2010 г. на полигоне Шабла в Болгарии. За исключением войны 1999 г., 250-я ракетная бригада не имела возможности выполнять пуски ракет в рамках боевой подготовки с 1989 г., когда пуски производились на побережье Ядрана и в СССР. В 2011 г. на полигоне Шабла практические пуски выполняли и летчики сербских МиГ-29 (с МиГ-29 ракеты не пускали с 2003 г.).
Каждый год растет средний налет на экипаж, хотя он еще и далек от прежнего среднего налета. Месячный расход керосина на авиабазе Батайница сейчас составляет порядка 100 т, а раньше 100 тонн керосина сжигали в Батайнице за летную смену. Ожидается, что в 2013 г. средний налет достигнет 80 ч. Также в 2013 г. ожидается поступление на вооружение новых средних вертолетов, замена аналогового приборного оборудования самолета «Супергалеб» на цифровое, что позволит использовать его для обучения летчиков истребителей 4- го поколения и повысит боевую эффективность. В следующем году запланировано принять на вооружение разработанный в Сербии БЛА среднего класса «Пегас». Наивысший приоритет имеет закупка нового многоцелевого истребителя, поскольку в ВВС и ПВО осталось лишь три боеспособных МиГ-29 и несколько МиГ-21 бис, которых совершенно недостаточно для защиты неба Сербии. Изучается возможность ремонта двух вертолетов Ка-28, находящихся в музее военной авиации. Вертолеты могут быть переоборудованы в противопожарные, но выполнить подобную доработку завод «Мома» не в состоянии, поэтому, вероятно, модернизации будет проводиться в России.
Невзирая на существующие проблемы, ВВС и ПВО способны охранять небо Сербии, чему свидетельством служит перехват и принуждение к посадке 9 мая 2012 г. истребителем МиГ-21 бис итальянского ультралайта TL-90, нарушившего воздушное пространство Сербии – итальянский пилот «случайно» сбился с курса.
Военной авиации Сербии предстоит тяжелая борьба за выживание, но есть традиция, согласно которой из сражения надо выходить победителем.
Истребитель Су-27