К концу августа 1988 г. Т10К-1 оснастили складывающимся крылом, однако самолет в таком виде прожил чуть больше месяца. 27 сентября Садовников выполнял на нем очередной испытательный полет, программа которого предусматривала определение прочности конструкции машины на сверхзвуковой скорости, исследование устойчивости и управляемости на больших углах атаки, имитацию отказа двигателя. При выполнении последнего задания, после отключения двигателя, из-за дефекта гидросистемы произошел отказ управления ПГО, что привело к сваливанию самолета, и летчику пришлось покинуть его. При катапультировании Николай Федорович получил травму позвоночника и вернуться к летной работе уже не смог. За мужество и героизм, проявленные при проведении испытаний, 31 октября 1988 г. выдающемуся летчику-испытателю Н.Ф.Садовникову было присвоено звание Героя Советского Союза.
После этой аварии основная нагрузка легла на Т10К-2, на котором в течение года по программе летно-конструкторских испытаний (ЛКИ) было выполнено около 300 полетов в условиях наземного базирования. Продолжались полеты и на экспериментальном Т10У-2. Значительная часть этой работы прошла на «Нитке». Ведущим летчиком фирмы по корабельной программе стал В.Г.Пугачев, а летом 1989 г. к нему присоединились молодые пилоты СН.Мельников и Е.И.Фролов. К посадке на палубу начали готовиться и военные испытатели из 3-го Управления ГК НИИ ВВС (Крымский филиал) – командир испытательного полка п-к К.А.Семкин, заместитель начальника Управления по летной работе п-к В.Н.Кондауров и др.
В целом, начавшиеся испытания подтвердили, как и ожидали конструкторы, что летные характеристики потяжелевшего после всех доработок более чем на 3000 кг самолета несколько ухудшились по сравнению с серийным Су-27. Например, максимальная дальность полета снизилась на 30-40%, а максимальные скорости и практический потолок – на 7-9%. Однако, несмотря на существенное увеличение посадочной массы, новая механизация крыла и ПГО позволили уменьшить скорость захода на посадку до 240 км/ч (у Су-27 – около 270 км/ч, и только в процессе выравнивания она гасится до 225-240 км/ч).
Предусматривалось, что ЛКИ Су-27К пройдут в 1990 г., в ходе первого выхода крейсера «Тбилиси» в море. Однако в 1988 г. коллегия МАП в очередной раз высказала сомнения в целесообразности создания тяжелого корабельного истребителя ПВО. Доводы приводились прежние: на корабле можно разместить большее количество МиГ-29К который изначально создавался как многоцелевая машина, а это позволяло решать одним типом самолета весь комплекс задач корабельной авиации. Однако разработчики Су-27К были уверены в своей правоте: создать ударный комплекс вооружения быстро не удастся, а при решении задач ПВО группировка Су-27К по эффективности будет превосходить МиГ-29К в полтора раза, что снимает вопрос о численности самолетов на борту корабля. Дополнительные аргументы в свою пользу «суховцы» получили после испытаний на «Нитке», которые показали, что посадочная скорость у «МиГа» несколько выше, чем у их машины. Стоит ли объяснять, что значат лишние 10 км/ч при посадке на палубу, когда допустимый промах исчисляется считанными метрами! И все же, этих доводов было недостаточно. Генеральный конструктор ОКБ Сухого М.П.Симонов считал, что только практический опыт полетов обоих самолетов с корабля позволит Су-27К завоевать «место на палубе». Поэтому он просил директора ЧСЗ Ю.И.Макарова изыскать возможность еще до окончания достройки и сдачи крейсера заказчику хотя бы на месяц вывести его в море для проведения испытаний самолетов. Опробовать свой истребитель на ТАКР раньше запланированного срока выразило желание и руководство ММЗ им. А.И.Микояна.