Весной 1757 года Фридрих вторгся в Чехию и подступил к Праге. Стремясь дать своему любимому деверю (брату мужа) Карлу-Александру Лотарингскому возможность стяжать военную славу, Мария-Терезия назначила его Верховным главнокомандующим. Фридрих II в мае 1757 года разбил силы Карла-Александра близ Праги, но не смог помешать отступлению австрийских войск. Пруссаки приступили к осаде и сильно обстреливали город. Армия под командованием генерала Леопольда Йозефа фон Дауна вовремя подоспела на помощь осажденным, нанесла поражение пруссакам в сражении под Колином (18 июня 1757 года) и вытеснила войска Фридриха из Чехии. Прусская армия понесла тяжелые потери.
В то же время французы теснили ганноверскую (английскую) армию, в Померании начали войну шведы, а русские напали на Восточную Пруссию. Казалось, Фридрих будет сломлен таким количеством врагов, но он упорно оборонялся. В ноябре французы и австрийцы были разбиты у Росбаха, а в декабре Карл-Александр Лотарингский потерпел поражение при Лейтене, что вынудило Марию-Терезию отозвать его и назначить Верховным главнокомандующим генерала Дауна.
Таким образом, к концу года Фридрих удержал в своих руках как Силезию, так и Саксонию. В 1758 году он вторгся в Моравию и осадил Ольмюц, но из-за недостатка продовольствия снял осаду и возвратился в свои владения. Генерал Даун преследовал его и 14 октября нанес поражение при Гохкирхене.
1759 год был для союзников еще более успешным. В Восточной Пруссии Фридрих потерпел поражение от русских при Кунерсдорфе. Австрийцы в сентябре овладели Дрезденом и в первый раз зимовали в Саксонии. В следующем году Фридрих собрал новую армию. 15 августа он разбил австрийцев при Лигнице в Силезии, а 3 ноября – в Саксонии при Торгау. Вся Саксония опять возвратилась под его власть. На этом обе стороны выдохлись и не могли более продолжать решительных действий. Финансы и в Австрии, и в Пруссии из-за длительной войны были полностью расстроены.
К тому же союзники стали один за другим покидать Марию-Терезию. В 1762 году умерла русская царица Елизавета Петровна, и ее преемник Петр III (внук по матери Петра I) заключил мир с Фридрихом. Затем вышла из войны Швеция. Франция заключила перемирие с Англией, уступив ей Канаду, и больше не имела нужды воевать с Пруссией. В этой ситуации Мария-Терезия поневоле была вынуждена подписать с Пруссией Хубертсбургский мир, по которому Силезия окончательно переходила к Пруссии, и который не принес Австрии никаких территориальных приобретений.
Мария-Терезия была набожной женщиной. Своей искренней религиозностью и строгой моралью она отличалась практически от всех европейских правительниц того времени.
Она «
Мария-Терезия «была слишком верна старой самодержавной Европе», и она «запретила масонские ложи в своей империи, что, как можно догадаться, не мешало им тайно распространяться и объединять в своих рядах все большее число единомышленников».