Созданная в административном порядке система специализированных банков вскоре показала свою неэффективность. Монополия одного банка сменилась монополией нескольких ведомственных банков. Инструментами денежно-кредитной политики остались административно утверждаемые кассовый и кредитный планы. Не создавались предпосылки для формирования финансовой инфраструктуры: денежного рынка, рынка капиталов, ценных бумаг, валютного рынка. Сохранилось принудительное прикрепление к банкам корпоративной клиентуры. Возросло управленческое звено банковской системы на уровне области, края и автономной республики. Поскольку реорганизация проводилась в пределах имевшейся штатной численности учреждений Госбанка, возник острый дефицит кадров на уровне отделений, которые и без того были перегружены работой.
Скорость прохождения платежных документов значительно замедлились. Резко возросли остатки невыясненных сумм, существенно увеличилось время обработки данных и составления сводного баланса как по каждому из специализированных банков, так и по банковской системе в целом. Как вспоминают ветераны банковской службы "сводить платежные документы было очень трудно, а не исполнить — невозможно". Рассказывают, что в здание Промстройбанка СССР на Тверском бульваре приезжали разгребать завалы из коробок с документами целые бригады работников областного звена со всех союзных республик.
Работа специализированных банков стала приходить в противоречие с нарождающимися рыночными отношениями, чему в значительной степени способствовала меняющаяся ситуация в стране, ибо партия и правительство провозгласило право предприятий самостоятельно решать все хозяйственные вопросы. Происходило массовое образование кооперативов, чаще всего путем выделения на самостоятельный баланс структурных подразделений крупных государственных заводов, фабрик и строительных организаций. Перестройка экономики сопровождалась ликвидацией системы материально-технического снабжения, что привело к возрождению обширной сети посреднических и торговых предприятий.
В качестве позитивных результатов банковской реформы 1987 года можно назвать прекращение кредитования убытков и сверхплановых запасов товарно-материальных ценностей, а также выдачи предприятиям и колхозам кредитов на восполнение утраченных оборотных средств. Изъятия излишних безналичных денежных средств (платежных и кредитных) из хозяйственного оборота было приостановлено, а собственные оборотные средства предприятий и колхозов увеличились до 30–50 % от потребности. Высвободившиеся краткосрочные кредитные ресурсы в размере свыше 75 млрд. руб. были направлены на финансирование неотложных государственных нужд.
После XIX партконференции, состоявшейся в конце июня 1988 г., в партийно-хозяйственной элите страны начинает углубляться раскол по критерию оценки степени допуска в экономические отношения и несоциалистических элементов. Консервативное крыло партийно-хозяйственной номенклатуры выступало за ограничение масштабов перестройки, сохранение основ социалистического планового хозяйства и административных принципов регулирования денежно-кредитных отношений. Демократическое крыло, вдохновляемое либерально-рыночными идеями, требовало доведения перестройки до полного крушения "административно-командной системы". М.С.Горбачев и его окружение пыталось проводить центристскую политику, допускало бесконечные колебания и зигзаги, теряя при этом политическую инициативу. Поддерживавшие Горбачева ученые-экономисты (Л.И.Абалкин, Н.Я.Петраков, Г.Я.Явлинский, С.С.Шаталин) отстаивали идеи, которые тяготели к концепциям западной социал-демократии, что никак не устраивало ни ортодоксальных коммунистов, ни радикальных либералов.
Хотя симптомы экономического и политического кризиса были уже налицо (дефицит импортных товаров, снижение темпов производства, неформальные общественные движения), самого кризиса пока еще не было, как не было самих признаков политических потрясений. Была эйфория от достигнутого уровня интеллектуальной и гражданской свободы, которая препятствовала взвешенному подходу к решению вопросов экономической реформы, особенно в такой важной сфере, как кредит и денежное обращение.