(до июня 1939 г. заказ № 45) После вступления в строй вошла в состав 2-го ДПЛ Первой эскадры Шестого флота, и до июля 1941 г. занималась боевой подготовкой во Внутреннем японском море. В июле 1941 г. I-18 включили в состав Специальной группы ПЛ капитана 1 ранга Ханку Сасаки, и до октября 1941 г. на подходах к бухте Токуяма (на юго-востоке о. Хонсю) занималась боевой подготовкой. 18.11.1941 г. корабль пришел в Куре, где на арсенале флота принял на борт карликовую лодку типа А. 25.11.1941 г. I-18 направилась к Гавайским о-вам. 5.12.1941 г. она заняла позицию в 100 милях к западу от о. Оаху. 6.12.1941 г. в восьми милях от берега корабль направил свою карликовую лодку в гавань Перл-Харбор для атаки боевых кораблей противника. 7.12.1941 г. группа Сасаки не добилась каких-либо результатов. 9.12.1941 г. I-18 оставила район ожидания и 13.12.1941 г. пришла на атолл Кваджелейн. 18.01.1942 г. она направилась к атоллу Мидуэй для его обстрела. 22.01.1942 г. ПЛ подошла к острову, но открыть огонь не смогла из-за противодействия береговых батарей (вызванного I-24) и поломки гирокомпаса, что не позволило точно выйти к намеченным для обстрела объектам. 5.02.1942 г. корабль возвратился на атолл Кваджелейн. С 19-го по 24.02.1942 г. I-18 вела поиск кораблей противника, обнаруженных базовой авиацией в районе к юго-востоку от Маршалловых о-вов. 27.02.1942 г. ПЛ направилась в район к западу от Гавайских о-вов для борьбы с судоходством противника. 28.03.1942 г. ее включили в состав 1-го ДПЛ Восьмой эскадры Шестого флота и перебазировали на Пенанг. 12.04.1942 г. корабль возвратился на атолл Кваджелейн и с 13-го по 27.04.1942 г. перешел в Пенанг с заходом на атолл Трук (18.04.1942 г.). 30.04.1942 г. I-18 направилась к восточному побережью Африки, имея на борту карликовую лодку типа А. 31.05.1942 г. она подошла к о. Мадагаскар на дистанцию 10 миль и безуспешно пыталась ее выпустить для атаки кораблей и судов противника в гавани Диего-Суариес. Задача не была выполнена из-за деформации палубных зажимов. В дальнейшем экипажу корабля удалось сбросить карликовую лодку за борт. 17.06.1942 г. I-18 (капитан 3 ранга Отани) у западного побережья Индии потопила английское торговое судно (4780 т), 27.06.1942 г. у о. Мадагаскар английское торговое судно (3610 т) и 8.07.1942 г. в центральной части Индийского океана — английское торговое судно (2914 т). 16.07.1942 г. ПЛ через перископ провела разведку подходов к Сейшельским о-вам и 29.07.1942 г. возвратилась в Пенанг. С 3-го по 5.08.1942 г. она перешла в Сингапур, где на базе флота Селетар провели текущий ремонт корпуса и механизмов. 3.09.1942 г. корабль возвратился в Пенанг. С 13.09 по 19.11.1942 г. I-18 патрулировала в Индийском океане. 16.11.1942 г. ее включили в состав Специального соединения контр-адмирала Хисао Мито. 13.12.1942 г. ПЛ пришла в Рабаул и начала подготовку к транспортной деятельности. С 6-го по 7.01.1943 г. корабль перешел в Буин и с 11-го по 18.01.1943 г. доставил в Каминпо (14.01.1943 г.) 25 т продовольствия и боеприпасов для стрелкового вооружения (вместо части запасных торпед и в палубных контейнерах). 20.01.1943 г. I-18 (капитан 3 ранга Мураоко) направилась к о. Эспириту Санто, имея на борту карликовую лодку типа А. 25.01.1943 г. ПЛ безрезультатно ее использовала против боевых кораблей противника и 29.01.1943 г. возвратилась в Буин. 5.02.1943 г. она вновь направилась к о. Эспириту Санто, имея на борту карликовую лодку типа А. 11.02.1943 г. в 200 милях к югу от о. Сан-Кристобаль корабль в надводном положении обнаружил бортовой ГСМ с американского ЛКР Неlеnа. Он вызвал ЭМ Fletcher, который глубинными бомбами (по данным гидроакустических приборов) потопил I-18. Какие-либо данные о боевом использовании карликовой лодки с корабля отсутствуют.