Другой арабский алхимик Абу Муса Джабир ибн Хайан (721–815), более известный под именем Гебер, дальше продвинулся в своих исследованиях. Его труды послужили основой для дальнейшего развития алхимии на многие столетия. Главным его достижением была разработка ртутно-серной теории происхождения металлов. Он полагал, что основой всех металлов являются философская сера и философская ртуть. Ртуть объясняла свойства металличности металлов, а сера — свойства горючести. Серу образовывают сухие испарения в недрах земли, а ртуть — мокрые испарения. Это был более конкретный шаг на пути изучения трансмутации металлов. Нужно обратить особое внимание, что философская ртуть и философская сера — не то же самое, что ртуть и сера как таковые. Обычные сера и ртуть лишь свидетельствуют о присутствии в металле философской ртути или серы. Также опыты Гебера опровергли бытующее мнение, что тепловое воздействие — это самый простой способ упрощения состава металла. Джабир ибн Хайан считал, что в недрах земли под воздействием температур при участии философской ртути и философской серы образуются свинец, железо, олово, ртуть, медь и серебро. Но для получения золота недостаточно участия только этих компонентов. Необходима более плотная субстанция, которую Джабир ибн Хайан называл al-ik sir (греч. «сухой»). Позднее эта субстанция приобрела название «философский камень» (Lapis Philosophorum). Ученый, получивший философский камень или овладевший его знанием, назывался адептом. При воздействии этой субстанции процесс возникновения золота в земле происходит гораздо быстрее. Таким образом, основной задачей алхимии становится получение «философского камня».
Для алхимиков философский камень — это реагент, превращающий в золото ртуть, свинец и другие неблагородные металлы. Его по-другому называли великим, эликсиром или магистериум, красной тинктурой, панацеей жизни. Именно раствор в определенных пропорциях философского камня дает жидкое золото, о котором будет рассказано чуть позже.
Наряду с философским камнем, существовала и еще одна субстанция, называемая белым львом, малым магистериумом, или белой тинктурой. Этой субстанции приписывались возможности превращать неблагородные металлы в серебро.
При дальнейшем изучении свойств металлов обнаружилось неприменимость ртутно-серной теории для определенных случаев. Например, при изучении солей металлов. Дополнения к этой теории внес Абу Бакр Мухаммед ибн Закарийа Ар-Рази (864–925), также известный как Разес. Он вводит философскую соль для объяснения растворимости или хрупкости этих веществ. Таким образом, ртутно-серная теория приобрела завершенность и просуществовала в таком виде многие десятилетия. Закарийа Ар-Рази огромное внимание в своих трудах уделяет описанию постановки эксперимента. Подробно записано все необходимое оборудование для проведения опытов, различные мисочки и другая посуда. Подробно записаны методы проведения различных опытов. Это позволило последователям не задерживаться на первоначальном этапе, а значительно дальше продвинуться в изучении.
Последним арабским алхимиком того периода является Ал Джидаки (XIV в). Основным его достижением стало объединение всех знаний и открытий, сделанных его предшественниками. Арабские алхимики нашли способ получения мышьяка, фосфора, уксусной кислоты и растворов сильных минеральных кислот. Арабская алхимия более рациональна, чем последующая европейская. Она содержит не так много мистики и тайны и направлена на достижение именно научных познаний.
После этого периода к XII в. крупнейшим центром алхимии становится Европа. Европейские алхимики придерживались взглядов Аристотеля, который считал, что весь мир состоит из некой первичной материи. Выражением этой материи являются стихии — огонь, вода, земля и воздух. Каждая стихия характеризовалась двумя качествами: «сухой» или «мокрый» и «горячий» или «холодный».
Так, изменяя одну из характеристик путем нагревания, выпаривания или перегонкой, можно было изменять состояние материи.
До сих пор сохраняется это деление в астрологии, с которой алхимия была тесно связана. Переплетение наук было настолько плотным, что изучались явления природы как таковые, но отнести их к какому-либо научному разделу было не возможно.
Необходимо отметить, что европейская алхимия имела сильные отличия от арабской алхимии. Европейская алхимия развивалась в католическом обществе под сильным гнетом церкви. В 1317 г. папа Иоанн XXII придал алхимию анафеме, что позволило в любой момент алхимика объявить еретиком и придать суду инквизиции. А, как известно из истории, суд инквизиции часто не был справедлив. И многие алхимики не могли открыто заниматься своими исследованиями, открыто объявить о своих открытиях. Европейская алхимия принимает «полуподвальное» положение. Несмотря на это, европейские монархи, а также сами служители церкви рассчитывали на выгоды от алхимических опытов.