В период между 1520 и 1529 годами Барбаросса стал хозяином почти всего североафриканского побережья между Гибралтарским проливом и заливом Габес. В 1529 году его заместитель Айдин-Рейс добился значительного успеха при столкновении с испанскими силами. В сражении у Балеарских островов его небольшая эскадра, состоявшая из легких галеотов, разгромила восемь крупнейших испанских военных галер, среди которых был флагман испанского средиземноморского флота. Айдин-Рейс вернулся в Алжир, ведя на буксире семь захваченных призов. Средиземноморье являлось полем боя между непримиримыми соперниками, испанцами и турками, еще много лет, однако в тот момент было очевидно, что турки одерживают верх.
Неудивительно, что правящий султан Сулейман I пожелал, чтобы его выдающийся подданный занялся реконструкцией судоверфей Константинополя и усовершенствованием управления османским флотом. Сулейман, которого европейцы при жизни называли Великолепным, а османы – Законодателем, был одним из самых замечательных правителей своей страны. При нем Османская империя достигла пика своего могущества. Он унаследовал от отца эффективную армию, хорошо организованную страну и полную казну. Со своей стороны, он старался использовать самых способных людей Блистательной Порты. Его выбор администраторов (которому нередко препятствовали гаремные интриги), как правило, был превосходным. Во время его правления к Османской империи добавился Аден, Алжир (благодаря Барбароссе), Багдад, Белград, Будапешт, Нахичевань, Родос, Риван, Тебриз, Темешвар. В этот период жизни, однако, хотя его армии побеждали на полях сражений Востока и Европы, султан был недоволен состоянием своего флота.
Знаменитый генуэзский адмирал Андреа Дориа, выходец из той же самой семьи, которая дала городу много хороших адмиралов, полководцев и администраторов, недавно объединил свои силы с императором Карлом V. Это означало, что испанский флот теперь усилен двенадцатью галерами Дориа, так же как выдающимися талантами адмирала. В 1532 году, к примеру, Дориа провел в высшей степени успешную кампанию против греческих аванпостов империи султана. Он захватил важный порт и торговый центр Патры и два форта, охранявшие вход в Коринфский залив. Он также взял порт Корон, что на Мессинском заливе, где разместил генуэзские и испанские войска.
Великий визирь Сулеймана по имени Ибрагим давно следил за Барбароссой, человеком, сделавшим себя правителем Алжира и превратившим западный бассейн Средиземного моря в свою собственную территорию. Он видел в нем противоядие Дориа. По его предложению весной 1533 года Барбаросса был призван в Константинополь, где предстал перед Сулейманом.
В следующем году Барбаросса, его помощники и советники, которых он привез с собой из Алжира, полностью реорганизовали константинопольские судоверфи. Они усовершенствовали турецкий флот, улучшив конструкцию судов, комплектование и обучение команд и управление, создав модель, которая прослужила Блистательной Порте много лет. Великий визирь не ошибся, когда после первой встречи с этим турком из Алжира написал султану: «Мы приобрели надежного человека моря. Не сомневайся, назначая его пашой, членом дивана и главнокомандующим флотом». Жан Чесно, французский секретарь в Константинополе в то время, доложил своему хозяину, Франциску I Французскому, что до Барбароссы «турки, за исключением некоторых корсаров, не знали ничего об искусстве мореплавания. Желая найти команды для своих судов, они отправлялись в горы Греции и Анатолии и приводили оттуда пастухов, чтобы те гребли на галерах и служили на других кораблях. Это было безнадежно, поскольку пастухи не знали, как грести и даже как прямо стоять в море. По этой причине турки никогда не показывались в море. Барбаросса сразу изменил всю систему». Адмирал Жюрен де ла Гравьер позже добавил: «Он изменил ее настолько, что всего за несколько лет они приобрели репутацию непобедимых».
Возможно, именно в этот период, когда турецкий флот находился в процессе реорганизации, Франциск I, вступивший в конфликт с императором Карлом, решился на известное изменение французской политики, которое сделало его католическую страну союзницей турок-мусульман. Если бы у императора были корабли и опыт Андреа Дориа, чтобы помочь ему против Франции, он бы, в свою очередь, получил корабли и адмирала султана. Барбаросса сам внушил эту идею султану. Он указал, что величайшим врагом мусульман – морисков, арабов, берберов или турок – является Карл V. Зимой 1533 года Барбаросса, «заразив людей собственной неуемной энергией, спустил на воду шестьдесят одну галеру… и смог выйти в море уже весной с флотом из восьмидесяти четырех галер. Он проводил дни и ночи в арсенале, где даже спал и ел, чтобы не терять времени».