Весной 1809 года, когда Жером находился у власти уже около восемнадцати месяцев, снова началась война с Австрией, и Вестфалия, наряду со всей оккупированной французами Германией, была приведена в боевую готовность. «Тугендбунд» — террористическое секретное общество, процветавшее в Пруссии, вело активную деятельность в Вестфалии, и германскими патриотами были совершены две попытки вторгнуться в эту страну, в то время как Наполеон был занят сражениями с Габсбургами на Дунае. Один заговор касался захвата в заложники Жерома офицерами из круга его приближенных, но при всей своей бешеной экстравагантности Жером не был лишен популярности, и заговор провалился. Ради безопасности король отправил свою жену Екатерину в Париж, а сам принял командование десятым корпусом, который был расквартирован в этом районе.
Как генерал, Жером был не более удачлив, чем как моряк или финансист. Когда Жером направлялся на войну, он и не подумал отказаться от домашнего комфорта и отбыл в сопровождении большой свиты, включавшей поваров, камергеров и даже группу дипломатов. Свое время Жером проводил в разъездах по «сфере операций» и после возобновившейся оккупации Дрездена заказал там постановку оперы «Те Деум», а потом посещал спектакли вплоть до эвакуации города вопреки распоряжению своего брата. Он мог бы добиться большего успеха в качестве боевого командира, довелись ему служить в неторопливом XVIII веке, но его брат ввел новые методы ведения войны, и выяснилось, что Жером, к сожалению, отстал от времени. Его приказы как командующего десятым корпусом касались наблюдения за действиями австрийцев против его собственной страны, Саксонии и всей Южной Германии. Наполеон, полностью занятый в районе Дуная, послал ему тщательно проработанный план, имевший целью втиснуть австрийскую армию между вестфальцами и корпусом под командованием генерала Жюно, который проявлял симпатию к Жерому еще со времени его поездки в Испанию и истории с Елизаветой Патерсон. Жером, однако, располагал множеством собственных идей, и они, как правило, были прямо противоположны замыслам его брата. Услышав, что англичане готовят десант в Голландии, он вместо выполнения приказа по его захвату направил свой корпус на север. Непосредственным результатом этого явилось поспешное отступление Жюно, и лишь перемирие спасло Жерома и его армию от полного уничтожения.
Наполеон пребывал в ярости. Задолженность казначейству и расплескивание денег подобно воде — уже одного этого достаточно, чтобы рассердиться, но риск катастрофы на поле боя из-за неподчинения приказу был равносилен преступлению. И гнев императора обрушился на Жерома как кипящее масло. Он уже писал Жерому, выражая недовольство его ведением боевых действий, и убеждал его «прекратить вести себя смехотворно, отослать свой дипломатический корпус обратно в Кассель, продвигаться без багажа и свиты, кормиться за своим собственным столом, вести войну как солдат, стремящийся к славе и военной репутации, и во имя Бога добиться достаточного смысла, чтобы говорить и писать как следует!». Но это письмо было мягким по сравнению с тем, которое Наполеон направил брату, когда он узнал о бесполезном продвижении Жерома на север. Это было самое длинное письмо из тех, которые когда-либо направлялись Жерому от императора, и в этом отношении оно было классическим. Подчеркнув огромный риск, которому подвергался Жером, не подчиняясь приказам, Наполеон писал: «Мне жаль, что ты даешь столь мало доказательств своего таланта или даже здравого смысла в военных делах. Это поведение придворного, еще не ставшего настоящим солдатом. Я был немного старше тебя, когда завоевывал Италию и разгромил австрийскую армию, в три раза более многочисленную, чем моя. Но со мной тогда не было льстецов и группы дипломатов. Я веду войну подобно солдату, и нет другого способа ее ведения. Я не устраивался ни как брат императора, ни как король. Я делал все возможное, чтобы побить врага… и если ты собираешься продолжать как начал, следуя своим фантазиям и не выполняя моих приказов, ты можешь оставаться в своем серале! Я очень боюсь, что бесполезно что-либо ожидать от тебя!»