С август по сентябрь 1914 года проводились сдаточные испытания на Ладожском озере, куда подводная лодка была доставлена на барже. В конце ноября подводная лодка железнодорожным транспортом была перевезена в Ревель (Таллинн), откуда перешла в Балтийский порт к месту базирования. Зимой 1915 года была отремонтирована и перевезена обратно в Ревель, где была включена в систему обороны Моонзундского архипелага.
Осенью 1915 года подводная лодка №-3 перевезена по железной дороге из Петрограда в Одессу и переведена в состав Дунайской флотилии Черноморского флота. По ходатайству экспедиции особого назначения, занимавшейся перевозкой грузов по Дунаю для сербской армии, Морской Главный Штаб принял решение о переброске в 1916 году подводной лодки №-3 по железной дороге на Дунай для оказания морального воздействия на австро-венгерскую военную флотилию.
В июне 1917 года подводная лодка переведена в состав сил Дунайской флотилии. 9 января 1918 года вошла в состав Черноморского флота. 18 января 1918 года вошла в состав Красного ЧФ.
12 марта 1918 года подводная лодка №-3 была оставлена в неисправном состоянии в районе Ренн на Дунае. Весной 1918 года в неисправном состоянии попала в румынскую, а затем в венгерскую флотилии. Предпринимались попытки привести подводную лодку в рабочее состояние, окончившиеся неудачно.
В 1921 году подводную лодку сдали на слом. Подводная лодка №-3 была разделана на металл на территории Венгрии.
Тактико-технические данные подводной лодки №-3:
Водоизмещение: надводное/подводное– 33.1/43.6 тонн. Главные размерения: длина – 20.38 метра, ширина – 2.18 метра, осадка – 1.8 метра. Силовая установка – один дизельный двигатель – 50 л.с.; один электродвигатель – 35 л.с. Скорость: надводная/подводная – 8/6 узлов. Запас топлива -1.3 тонны (солярка). Аккумуляторная батарея: одна группа по 50 элементов – 810 А.ч. Дальность плавания: надводная/подводная – 150 миль при 8 узлах/18 миль при 6 узлах. Вооружение – 2 навесных 457-мм торпедных аппарата. Глубина погружения: предельная – 40 метров. Команда: 6–8 подводников.
Подводные лодки №-1, №-2 и №-3 (тип 13, тип «Holland XXVIIB») на железнодорожных транспортерах.1914 год.
Подводная лодка №– 3 под венгерским флагом у борта парохода «Самсон» на Дунае.1918–1919 гг.
Подводная лодка №-3 под Андреевским флагом.
Подводная лодка №-3 на Австро-Венгерском флоте.
Подводная лодка тип «АГ» (Holland-602GF) построена в 1916 году для ВМС Великобритании по проекту фирмы «Elektrik Boat Со» на судоверфи «Barnet Yard» в Ванкувере (Канада). 19 сентября 1916 года приобретена заводом «Ноблесснер» по заказу Морведа России и 21 августа 1917 года зачислена в списки кораблей Черноморского флота. В этом же году в разобранном виде доставлена морским путем во Владивосток, а оттуда по железной дороге на завод «Наваль» в Николаев для достройки, где 28 марта 1917 года была перезаложена под обозначением АГ-21. Работами по сборке подводной лодки руководили представители американской фирмы. Незадолго до начала октябрьского переворота в 1917 году подводная лодка была спущена на воду.
В апреле 1918 года подводная лодка была захвачена германскими войсками. После их ухода из Крыма АГ-21 вошла в состав Морских Сил Юга России русской Добровольческой армии. 24 ноября 1918 года АГ-21 была захвачена в Севастополе англо-французскими войсками.
26 апреля 1919 года во время эвакуации из Крыма вооруженного контингента стран Антанты по приказу английского командования АГ-21 в числе других тринадцати русских подводных лодок была затоплена в районе Севастополя. Подводную лодку вывели на рейд с помощью буксира «Елизавета», и, открыв люки и пробив борт, затопили.
В 1926 году подводная лодка была найдена на дне судоподъемной партией ЭПРОНа. АГ-21 лежала на дне близ Севастополя, сильно углубленная в ил, с креном 40° на глубине 50 метров. Судоподъемные работы продолжались с конца 1926 по первую половину 1928 года. АГ-21 стала единственной из потопленных англичанами русских подводных лодок, которая после подъема подлежала восстановлению.
21 мая 1928 года подводная лодка была поднята ЭПРОН и 30 декабря 1930 года вошла в состав Морских Сил Черного моря. 3 февраля 1931 года получила наименование «Металлист» (бортовой №-16). 8 июня 1931 года подводная лодка, выполняя учебную торпедную атаку, была таранена кораблем – целью эсминцем «Фрунзе» и затонула на глубине 28 метров у устья реки Бельбек. При аварии погибло 24 человека из команды подводной лодки. Девятерым удалось спастись; шестеро всплыли с воздушным пузырем в момент гибели подводной лодки, троих извлекли спустя 42 часа из кормового отсека уже после подъема подводной лодки. Командир подводной лодки и еще два подводника, пытаясь выйти на поверхность, погибли при всплытии. Через два дня подводная лодка была поднята и после ремонта 1 января 1932 года вновь введена в строй.