«Заговор» был с самого начала изобретением Сталина, и только его одного. Об этом рассказал Хрущев на XX съезде партии в 1956 году: «Позвольте мне остановиться на деле о заговоре врачей… В принципе такого дела вовсе не существовало, если не считать заявления врача Тимашук, которой кто-то подсказал или приказал направить письмо Сталину — в конце концов, она была секретным сотрудником органов госбезопасности. Вскоре после ареста врачей мы, члены политбюро, получили протоколы с признаниями ими своей вины… Дело при этом было представлено так, что факты, на которых основывалось следствие, проверить не мог никто… Когда же после смерти Сталина мы расследовали это «дело», то установили, что оно от начала и до конца было высосано из пальца. Это позорное дело было сконструировано Сталиным, но у него уже не оставалось времени довести его до конца — до того конца, который имел в виду он».
Сегодня известно, что Сталин требовал быстро провести процесс и уже заранее определил способ казни, а именно: не расстрел, а повешение. Хрущев сообщил, что Сталин приказал надеть на своего личного врача Виноградова наручники и добиться «добровольных признаний у врачей-вредителей» при помощи пыток и избиений. Тогдашнему министру госбезопасности товарищу Игнатьеву Сталин сказал дословно следующее: «Если Вы не добьетесь у врачей признаний, то мы Вас укоротим на голову». Также и Лаврентий Берия, будучи уже сам обвиняемым, показал на допросе, что врачи были арестованы по незаконным мотивам и по ложным обвинениям, а их признания были добыты незаконными методами. Жертвы были обречены на неминуемую смерть, от которой их, к счастью, в последний момент спасла своевременно последовавшая смерть самого Сталина. Однако когда эти «убийцы в белых халатах», эти «палачи человеческого общества» были освобождены из Лефортовской тюрьмы, двое из них уже погибли от последствий инквизиторских пыток.
После публикации 13 января 1953 года статьи Сталина «Об аресте «кремлевских врачей-террористов» все ждали начала всеобщей «бурной, всеохватной и беспощадной» чистки. Против каких «врагов народа» будет направлен план его мести, недвусмысленно намекнул сам Сталин: «Некоторые наши советские органы и их руководители утратили бдительность и заражены невнимательностью. Органы госбезопасности не сумели вовремя вскрыть вредительскую, террористическую организацию среди врачей». Кого он имел в виду, ясно из угрожающей концовки этой статьи: «Советский народ с гневом и возмущением клеймит позором преступную банду убийц и их заграничных хозяев. Он раздавит презренных наймитов, продавшихся за доллары и фунты стерлингов, как отвратительную гадину. Что же касается вдохновителей этих подлых убийц, то они могут быть уверены, и мы заверяем их в этом со всей серьезностью, что их также настигнет возмездие».
В ЦК «группе четырех», к которой принадлежали Берия, Маленков, Булганин и Хрущев, в действительности державшей в своих руках власть после XIX съезда, слишком хорошо был известен этот сталинский язык, чтобы не понять, против кого лично направлены эти стрелы. Они точно знали, что, если власть Сталина не будет своевременно сломлена, то дни их сочтены. Подробности этого переворота до сих пор еще известны не полностью. Известно лишь, что Берия и его коллеги предъявили Сталину ультиматум, в котором потребовали не только освобождения ни в чем не повинных врачей, но и отставки Сталина со всех постов. Пойти на столь рискованный шаг они решились только потому, что к этому моменту им, скорее всего, при содействии главаря заговора Берии удалось побудить Сталина арестовать генерал-майора Власика и генерал-лейтенанта Поскребышева и таким образом разрушить «непреодолимое ранее внутреннее кольцо» вождя. Не исключено, что в этот план входил и арест кремлевских врачей, ибо таким образом Сталин сам перекрыл для себя возможность быстрой врачебной помощи. Если верить сотруднику Коминтерна Францу Боркенау, то арест и профессора Виноградова, и начальника лечсанупра Кремля профессора Егорова произошел по инициативе Берии и с ведома и согласия Маленкова, Булганина и Хрущева. В этом случае утверждение Хрущева о том, что «дело врачей» организовано Сталиным единолично, было, скорее всего, направлено на то, чтобы обелить себя и своих сообщников.