Если при Тесее Трезен подчинен Афинам. Но афиняне к Тесею с течением времени стали относиться враждебно, и его власть не продолжилась в царской династии. В походе на Трою Афины выступают как второстепенное государство, а Трезен упоминается в каталоге кораблей среди аргосской части флотилии – в числе 80 кораблей под руководством Диомеда. После завоевания Пелопоннеса дорянами, Трезен остался в сфере влияния Аргоса, без борьбы подчинившись Гераклидам. При этом могущество города возросло до того, что он смог основать две колонии – Галикарнас и Минду в Карии. Но к началу 7 в. до н.э. соотношение сил на Пелопоннесе изменилось, и Трезен подчинился Спарте.
До греко-персидских войн о Трезене мы знаем лишь одно упоминание Трезена – у Геродота указывается, что изгнанные Поликратом самосцы на деньги, награбленные на о. Сифнос (Киклады), купили у гермионян о. Гидрею (перед Гермионской бухтой), и поручили его охрану трезенцам. Эта информация подтверждает, что Трезен обладал достаточной силой, чтобы оборонять остров и иметь для этого необходимые корабли и воинов. Также ясно, что гермионцы не были в состоянии защитить этот остров.
Следующее упоминание о Трезене у Геродота связано со сражением у о. Саламин, которое изменило течение войны с персами. При этом бывшие трезенцы, оказавшиеся на пути персидской армии и жившие в Галикарнасе, оказались на стороне персов во флотилии царицы Артемисии. Также здесь были выходцы из Эпидавра, жившие в колониях, основанных городом. Что касается коренных жителей Трезена, то они снарядили против персов 5 кораблей (для сравнения, в битве при Артемисии: афины – 127 кораблей, Коринф – 40, Сикион – 12, Эпидавр – 8, при Саламине численность контингентов почти не изменилась), свою гавань предоставили для сбора греческого флота, а жилища – для беженцев из Афин.
Перед сражением трезенцы потеряли один сторожевой корабль, который настигли персы, захватили и казнили самого красивого и сильного воина Леонта. Считается, что это была жертва Ваалу, статуя которого размещалась на носу персидского корабля.
После победы при Саламине трезенцы участвовали в укреплении Истмийского перешейка, а затем в битве при Платеях участвовала 1 тыс. воинов из Трезена. Геродот перечисляет трезенцев среди наиболее отличившихся при Платеях (вместе с коринфянами и сикионянами). Также трезенцы были участниками в битве при Микале.
В Пелопоннесской войне Трезен выступал на стороне Спарта, а первоначально – на стороне Коринфа в конфликте с Керкирой. В отместку Афины в 430 г. до н.э. разорили Трезенскую область, затем в 425 г. укрепились в соседней Мефане и продолжали грабить трезенские земли.
И в дальнейшем Трезен был на стороне Спарты: во время Коринфской войны 394 г. до н.э., в войне Спарты с Афинами в 373 г. до н.э.
В эллинистические времена Трезен, как и весь Пелопоннес, стал ареной борьбы между новыми претендентами на гегемонию: македонянами, ахейцами, спартанцами и римлянами. В результате борьбы за власть между македонскими правителями Кассандром и Деметрием Полокертом, Трезен и другие города получили свободу. Деметрий освобождал их от присутствия македонских гарнизоном и призывал совместно выступить против Кассандра. К 303 г. до н.э. македонские войска Греция практически полностью была освобождена, а Деметрий разместил свою резиденцию в Парфеноне. Но в 301 г. до н.э. Деметрий и Антигон были разбиты в битве при Ипсе коалицией диадохов Кассандра, Птолемея, Селевка и Лисимаха, и Деметрию с большим трудом удалось вернуть себе власть лишь над Афинами, где он правил еще семь лет. В Трезене снова разместился македонский гарнизоном. В 278 г. до н. э. Трезен был освобожден от македонцев спартанским царевичем Клеонимом, но в дальнейшем он перешел на сторону Пирра и помогал ему в войне со Спартой, а Трезен присоединился к Ахейскому союз. В 223 г. до н.э. спартанцы вновь отвоевали город, видимо, опираясь на поддержку своих сторонников.
С падением значение Афин в условиях римского господства Трезен приобрел больший вес и, по свидетельству Страбона, в I в. был процветающим городом. Что подтверждают и описания Павсаний несколькими десятилетиями спустя.
Трезен у Павсания
На акрополе Трезена Павсаний видел бронзовое изображение Тесея, который поднимает камень, под которым лежали меч и сандалии Эгея – знаки, по которым царь Афин должен был узнать своего сына. Также там находилось изображение Тесея, убивающего того быка, из-за которого у афинян возник конфликт с Миносом. Тесей (видимо, уже после возвращения с Крита) загнал его на афинский акрополь и принес в жертву богине.
На акрополе также находился храм Афина Сфениады (Могучей) с деревянной статуей. Ниже акрополя размещался храм Пана Литерия (Избавителя): якобы древний бог открыл трезенцам, как избавиться от чумы, которая перекинулась в город из Афин. Вблизи – храм Исиды, а за ним – храм Афродиты Акреи (Владычицы высот), построенный галикарнасцами, выходцами из Трезена.