С января 1985 года снова исполнял обязанности спикера «Хартии-77», на этот раз вместе с Эвой Кантурковой и Петрушкой Шустровой. Статьи и комментарии Динстбира печатались в зарубежных и эмигрантских изданиях, он выпускал нерегулярный журнал «Комментарии» («Komentáře»), посвященный международной политике. В 1986 году выпустил в самиздате книгу «Мечты о Европе», а двумя годами позже в соавторстве с Карелом Ланским – «Радио против танков», посвященную радиопередачам августа 1968 года. С января 1988 года член, а позднее глава редколлегии самиздатской газеты *«Лидове новины»
. Также был членом Кружка друзей *«Польско-чехословацкой солидарности» и *Движения за гражданские свободы.Участвовал в *Гражданском форуме
. От имени его пражского центра выступал на первой большой демонстрации в Братиславе. Стал пресс-секретарем ГФ, ежедневно проводил пресс-конференции в пражском театре «Laterna Magica», где был штаб Координационного центра ГФ. 10 декабря 1989 года занял пост министра иностранных дел в правительстве национального согласия. На первых свободных выборах в июне 1990 года был избран от ГФ в палату народа Федерального собрания. В конце февраля 1991 года стал председателем Гражданского движения, одной из двух партий, возникших в результате распада ГФ. Обязанности министра иностранных дел ЧСФР и депутата исполнял до следующих выборов в июне 1992 года, которые Гражданское движение проиграло.С 1992 года был членом Комиссии по глобальному управлению (Commission on Global Governance), изучающей возможности реформы ООН, международных институтов и международного права. В 1993 году Бургундский университет в Дижоне присудил Динстбиру докторскую степень honoris causa. В 1994–1997 годах он был депутатом Пражского городского совета. С 1995 года представлял президента Вацлава Гавела в так называемой группе Карлссона, объединяющей 16 лидеров стран, стремящихся реформировать ООН.
В 1997–1999 годах Динстбир преподавал в университете Клермонт-Грэдуэйт в Калифорнии и в университете Чейпел-Хилл в Северной Каролине. В 1998–2001 годах был специальным докладчиком Комиссии по правам человека ООН по бывшей Югославии. В ноябре 2000 года выставлял свою кандидатуру на дополнительных выборах в Сенат от Чешской социал-демократической партии, но проиграл. В 2007 году обсуждался вопрос о выдвижении Динстбира кандидатом в президенты, но в итоге он отказался от участия в выборах. В 2008 году был избран в Сенат, где возглавил Комиссию иностранных дел, обороны и безопасности.
Был награжден орденом «За заслуги» первой степени (2002).
Умер в Праге.
Письмо из тюрьмы [делегациям Мадридской конференции] // РМ. 13.11.1980. (Соавт. В. Бенда, В. Гавел).
Интервью. [Интервьюеры Н. Асадова, А. Дурново] // Эхо Москвы. 01.07. 2010. URL: https://echo.msk.ru/programs/razvorot/691588-echo/ (дата обращения 26.10.2018).
Sněni o Evropě. (Politický esej). Praha, 1986. (Самиздат); Praha, 1990.
Rozhlas proti tankům // Dienstbier J., Lánský K., Šilhán V., Šimon B. Srpen 1968. Koln, 1989. (Соавт. K. Lánský).
Janá Klusaková a Jiři Dienstbier rozmlouvají nadoraz nejen o tom, jak si stojíme ve svete. Praha, 1993.
Zpráva Komise pro globálni řizeni. Naše globální sousedství. Praha, 1995. (Соавт. I. Carlsson, S. Ramphal).
Od snění k realitě: Vzpomínky z let 1989–1999. Praha, 1999.
Bytem w hrŭze. Kresby z vězeni Otmar Oliva. Velehrad, 2002
Daň z krve. Praha, 2002.
V hlavní roli Ferdinand Vaněk / sest. L. Jungmannová. Praha, 2006.
O hostitelích a hostech (divadelní hry) / sest. L. Jungmannová. Praha, 2011.
Mikoláš R. Jiří Dienstbier. Žít naplno. Praha, 2012.
Rozhlasový zpravodaj 1958–1969. Praha, 2013.
Hoppe J. Pražské jaro v médiích: Výběr z dobové publicistiky. Praha, 2004.
Prečan V., Císařovská, B. Charta 77: Dokumenty 1977–1989. Praha, 2007.
Blažek P., Pažout J. Nejcitlivější místo režimu: Výbor na obranu nespravedlivě stíhaných (VONS) pohledem svých členů. Diskusní setkání 19. října 2007. Praha, 2008.
Blažek P., Bursík T. Pražský proces 1979. Vyšetřování, soud a věznění členů Výboru na obranu nespravedlivě stíhaných: Dokumenty. Praha, 2010.
Vilímek T. Solidarita napříč hranicemi: Opozice v ČSSR a NDR po roce 1968. Praha, 2010.
Otáhal M. Opoziční proudy v české společnosti 1969–1989. Praha, 2011.
Rožánek F. Srpen 1968. Prvních sedm dnů okupace. Praha, 2013.
Pažout J. a kol. Výbor na obranu nespravedlivě stíhaných 1978–1989: Edice dokumentů. Praha, 2014.
Bolton J. Světy disentu. Charta 77. Plastic People of the Universe a česká kultura za komunismu. Praha, 2015.