Эпигенетика

CpG island searcher ? Алгоритм поиска последовательности островков CpG http://www.uscnorris.com^/cpgislands2/cpg.aspx

Импринтинг

Mouse genomic imprinting ? Хромосомные карты мыши, показывающие известные импринтированные районы http://www.mgu.har.mrc.ас.ик/research/imprinting/

Gene Imprint ? Информационные ресурсы WWW по геномному импринтингу http://www.geneimprint.com/index.html

Impnnted Gene Catalogue ? База данных по импринтированным генам http://igc.otago.ac.nz/home.html

Candidate imprinted transcripts ? Ресурс предсказанного импринтированного транскриптома человека и мыши http://fantom2.gsc.riken.go.jp/imprinting/ (продолжение на следующей странице)

RNA

NONCODE ? База данных, посвященных некодирующим РНК http://www.bioinfo.org.cn/NONCODE

RNAdb ? База данных по некодирующим РНК млекопитающих http://research.imb.uq.edu.au/madb

Micro RNAdb ? База данных по микроРНК эукариот http://166.111.30.65/micromadb/

miRBase ? Ресурс данных по микроРНК http://microma.sanger.ас.uk/

NARNA ? Платформа для поиска природных антисмысловых транскриптов http://www.nama.ncl.ас.uk/

ASRP ? Ресурс данных по малым siPHK и miPHK Arabidopsis thaliana http://asrp.cgrb.oregonstate.edu/

Коммерческие сайты ресурсов по эпигенетике

Abeam ? Поставщики антител к гистонам http://www.abeam.сот/

Upstate ? Поставщики антител к гистонам http://www.upstatebiotech.сот/

Epigenomics ? Диагностический скрининг метилирования ДНК http://www.epigenomics.com/

Ресурсы и базы данных по геномам организмов

Все эукариоты

NCBI ? Портал к сайтам по множественному геномному анализу и ссылкам http://www.ncbi.nlm.nih.gov

ENSEMBL ? Браузер по эукариотическим геномам http://www.ensembl.org

UCSC Genome Bioinformatics ? Портал геномных последовательностей и ресурсов http://genome.ucsc.edu

EBI ? Портал к различным ресурсам по компьютерному анализу генома и протеома http://www.ebi.ac.uk/services

Sanger Institute ? Портал к ресурсам по последовательностям, биоинформатике и протеомике http://www.sanger.ac.uk/

BCM Search Launcher ? Портал для поиска последовательностей и средств анализа http://searchlauncher.bcm.tmc.edu/docs/sl_links.html

zPicture ? Средства сравнительного анализа последовательностей http://zpicture.dcode.org

iHOP ? Информация с гиперссылками по ресурсам белок — белок http://www.ihop-net.org/UniPub/iHOP/

Repeat Masker ? Алгоритм повторящихся последовательностей для идентификации повторяющихся последовательностей ДНК http://repeatmasker.org

Primer 3 ? Базирующаяся на Web программа конструирования праймеров http://frodo.wi.mit.edu/cgi-bin/primer3/primer3.cgi

Отдельные организмы

S. cerevisiae

— SGD — база данных по геному Saccharomyces http://www.yeastgenome.org

— ENSEMBL ? портал анализа генома S. cerevisiae http://www.ensembl.org/Saccharomyces_cerevisiae/index.html

S. pombe

— Портал к сайтам по геномным последовательностям, родственным S. pombe, и по их анализу http://www.sanger.ac.uk/Projects/S_pombe/

T. thermophda

— TGD — база данных по геному Tetrahymena http://www.ciliate.org/

— Проект по секвенированию макронуклеарного генома Tetrahymena http://www.genome.gov/12512294

A. thaliana

— TAIR — ресурс информации по Arabidopsis GRAMENE — сравнительная геномика трав http://www.arabidopsis.org http://www.gramene.org/

— Ресурс по геному риса http://www.tigr.org/tdb/e2kl/osa1/

C. elegans

— Портал к ресурсам по C. elegans http://www.wormbase.org/

— ENSEMBL — портал по анализу генома C. elegans http://www.ensembl.org/Caenorhabditis_elegans/index.html

— Портал к сайтам по геномным последовательностям, родственным С elegans, и их анализу http://www.sanger.ac.uk/Projects/C_elegans/

Drosophila