Эпигенетика

Silverman L.R., Demakos E.P., Peterson B.L., Komblith A.B., Holland J.C., Odchimar-Reissig R., Stone R.M., Nelson D., Powell B.L., DeCastro CM., et al., 2002. Randomized controlled trial of azacitidine in patients with the myelodysplastic syndrome: A study of the cancer and leukemia group B. J. Clin. Oncol., 20: 2429-2440.

Srinivasan P.R. and Borek E., 1964. Enzymatic alteration of nucleic acid structure. Science 145: 548-553.

Suzuki H., Gabrielson E., Chen W., Anbazhagan R., van Engeland M., Weijenberg M.P, Herman J.G., and Baylin S.B., 2002. A genomic screen for genes upregulated by demethylation and histone deacetylase inhibition in human colorectal cancer. Nat. Genet. 31: 141-149.

Suzuki H., Watkins D.N., Jair K.W., Schuebel K.E., Markowitz S.D., Chen W.D., Pretlow T.P., Yang B., Akiyama Y., Van Engeland M., et al., 2004. Epigenetic inactivation of SFRP genes allows constitutive WNT signaling in colorectal cancer. Nat. Genet. 36: 417-422.

Toyota M., Ho C., Ahuja N., Jair K.W, Li Q., Ohe-Toyota M., Baylin S.B., and Issa J.P., 1999. Identification of differentially methylated sequences in colorectal cancer by methylated CpG island amplification. Cancer Res. 59: 2307-2312.

Ushijima T., 2005. Detection and interpretation of altered methylation patterns in cancer cells. Nat. Rev. Cancer 5: 223-231.

Veigl M.L., Kasturi L., Olechnowicz J., MaA.H., LutterbaughJ.D., Periyasamy S., Li G.M., Drummond J., Modnch P.L., Sedwick W.D., and Markowitz S.D., 1998. Biallelic inactivation ofhMLHl by epigenetic gene silencing, a novel mechanism causing human MSI cancers. Proc. Natl. Acad. Sci. 95: 8698-8702.

Wales M.M., Biel M.A., el Deiry W., Nelkin B.D., Issa J.P., Cavenee W.K., Kuerbitz S.J., and Baylin S.B., 1995. p53 activates expression of HIC-1, a new candidate tumour suppressor gene on 17pl3.3. Nat. Med. 1: 570-577.

Wijermans P., Lubbert M., Verhoef G., Bosly A., Ravoet C, Andre M., and Ferrant A., 2000. Low-dose 5-aza-2’-deoxycytidine, a DNA hypomethylating agent, for the treatment of high-risk myelodys-plastic syndrome: A multicenter phase II study in elderly patients. J. Clin. Oncol. 18: 956-962.

Wolf P., Hu Y.C., Doffek K., Sidransky D., and Ahrendt S.A., 2001. 0⁶-methylguanine-DNA methyltransferase promoter hypermethylation shifts the p53 mutational spectrum in non-small cell lung cancer. Cancer Res. 61: 8113-8117.

Wolffe A.P., 2001. Chromatin remodeling: Why it is important in cancer. Oncogene, 20: 2988-2990.

Yamashita K., Upadhyay S., Osada M., Hoque M.O., Xiao Y., Mori M., Sato R., Meltzer S.J., and Sidransky D., 2002. Pharmacologic unmasking of epigenetically silenced tumor suppressor genes in esophageal squamous cell carcinoma. Cancer Cell 2: 485-495.

Приложение 1. WWW-ресурсы

Web-сайты, имеющие отношение к хроматину и эпигенетике

Chromatin Structure and Function ? Страница ресурсов по хроматину Джима Боуна http://www.chromatin.us

Epigenome Network of Excellence ? Web-сайт Европейской междисциплинарной сети исследований по эпигенетике http://www.epigenome-noe.net

HEP ? Исследовательский консорциум по проекту «Эпигеном человека» http://www.epigenome.org/

ENCODE ? Энциклопедия элементов ДНК: идентификация функциональных элементов у человека http://www.genome.gov/12513456

ChromDB ? База данных по хроматину растений http://www.chromdb.org/

Ресурсы по гистонам

The NHGRI histone database ? Содержит информацию по последовательностям гистонов http://research.nhgn.nih.gov/histones/

Abeam histone page ? Содержит загрузки карт модификаций гистонов http://www.abcam.com/chromatin

Histone.com page (Upstate) ? Карта модификаций гистонов, созданная Upstate http://www.histone.com/modification_map.htm

Белки хроматина

NPD-Nuclear Protein Database ? Коллекция известных белков позвоночных, локализованных в ядре http://npd.hgu.mrc.ас.uk/index.html

Chromatin proteins ? Линк с исследованиями on the NPD site ограниченными семействами белков хроматина http://www.epigenome-noe.net/researchtools/structure.php

Flybase chromatin page ? Покрывает Polycomb, trithorax и другие белки хроматина у Drosophila http://flybase.bio.indiana.edw'allied-data/lkinteractive-fly/aignfam/polycomb.htm

Метилирование ДНК

MethDB ? База данных по метилированию ДНК человека http://www.methdb.de/

DNA methylation society ? Web-сайт, посвященный аспектам биологического метилирования http://www.dnamethsoc.com/