Тем временем, на фронте в Нормандии произошли важные перемены. После того, как крупные силы немцев были окружены в мешке возле Фалеза, противник начал общее отступление к Сене. 20 августа британская 2 Армия нанесла удар на восток вдоль побережья. Гавр был обойден, зато Дьепп был захвачен 1 сентября. Через неделю был захвачен порт Остенде. 4 сентября британские войска вошли в Антверпен, и оказалось, что этот огромный порт практически не пострадал. Флот полагал, что нужно очистить от немцев берега Шельды и захватить остров Валхерен в устье этой реки. Пока не будут решены эти задачи, Антверпен будет для нас совершенно бесполезен. Наступление наших войск во Франции и Бельгии развивалось такими темпами, что они начали испытывать нехватку припасов. Они были вынуждены почти прекратить наступление, поэтому нам требовалось найти возможность доставлять грузы куда-нибудь ближе к линии фронта, чем в порты Нормандии. Но эта стратегия не была принята. Крупные силы остались в тылу, осаждать порты на берегах Ла Манша. В начале сентября начался комбинированный штурм Гавра с моря, суши и воздуха. 12 сентября город пал. Но Булонь продержалась до 22 сентября, а Кале был захвачен только 1 октября. В каждом случае аварийные партии флота тут же появлялись в портах. Однако порты были заблокированы потопленными кораблями, засорены минами, и приходилось тратить по несколько недель, чтобы привести их в порядок. Эти события ознаменовали завершение второй фазы операции «Нептун». 7 сентября был закрыт последний участок высадки («Джюно»), и комендант британской зоны контр-адмирал Риветт-Карнак перенес свой флаг из Арроманша в Руан. Всего в ходе десантной операции мы высадили на побережье около 350000 человек, 152000 машин и 1,5 миллиона тонн грузов, в основном в районы первоначальных плацдармов. Наши корабли имели 28 боев с кораблями противника и вытралили более 600 мин. Крупные и мелкие корабли артиллерийской поддержки обстреляли сотни целей на побережье по запросам армии. Теперь жизнь на участках высадки постепенно замирала, и через 3 месяца они вернулись к своей первозданной тишине. Корабли, охранявшие якорные стоянки, переместились на восток, чтобы выполнять новые задания.
Захват Антверпена породил разногласия между фельдмаршалом Монтгомери и генералом Эйзенхауэром относительно дальнейшей стратегии. Первый хотел нанести удар на узком фронте на северо-восток в сердце Германии, а второй предпочитал наступление к Рейну широким фронтом. 17 сентября под Арнемом был высажен парашютный десант, однако он не сумел захватить плацдарм на другом берегу Рейна. Не увенчалась успехом и первая попытка Монтгомери нанести удар на северо-запад от Антверпена. И все это время не предпринималось никаких попыток очистить от противника берега Шельды. В этот критический момент в Квебеке состоялось совещание Объединенного Комитета Начальников Штабов. 10 сентября Комитет убедил генерала Эйзенхауэра принять меры для использования Антверпена. Адмирала Рамсея давно беспокоили задержки с расчисткой устья Шельды. 5 октября он резко выступил против Монтгомери, заявившего, что «может захватить Рур и без Антверпена». Лишь в середине октября командующий 21-й группой армий согласился принять меры для открытия порта.