В стране, находившейся пока что на ранней стадии индустриализации, отправка рабочей силы в армию сама по себе порождала немало сложностей. Самой серьезной проблемой для Фрейсине была именно численность призывников. Прежде всего, откуда набирать для них офицерский состав? 16 сентября командующий одной воинской частью соединения, дислоцированного в Блуа, в письменной форме докладывал, что в настоящее время под его командованием состоят 940 человек, и он ожидает прибытия еще 1500 человек, а у него для них всего 6 офицеров и 19 человек унтер-офицерского состава. В первую очередь Фрейсине предстояло удвоить численность пехотных рот, таким образом, численность офицеров сокращалась вдвое: этот метод он заимствовал из федеральной армии (армии северян) периода Гражданской войны в США. Последствия этого, как и в Соединенных Штатах, были прискорбными. Это в значительной степени затрудняло поддержание на должном уровне воинской дисциплины, да и маневренность на поле боя превращалась в почти нерешаемую проблему. Войска национальной обороны превращались во множество очень больших по численности подразделений и частей, способных к выполнению лишь простейших указаний, да и то крайне медленному. Невзирая на численность, эти подразделения и части с трудом противостояли небольшим, дисциплинированным и управляемым формированиям пруссаков: большие по численности формирования французов были не только сильно уязвимы для винтовочного огня противника, но и для его артиллерии, если находились в обороне. Разумеется, наличие офицерского состава представляло собой проблему, но и подобный подход не разрешал ее. Закон от 10 августа, согласно которому призыву подлежали мужчины в возрасте до 35 лет, уже отслужившие в армии, предусматривал призыв в том числе и офицеров, и унтер-офицеров. Решительный отказ Гамбетты от установленного порядка во многом облегчил задачу. Согласно декрету от 13 октября, были отменены все ограничения на продвижение по службе, что открывало возможность присвоения генеральских званий таким энергичным молодым офицерам, как полковники Билло, Кремер и де Сони. На следующий день, согласно декрету, объединялись все войска, не принадлежавшие регулярной армии, – мобильная гвардия, призывники, «вольные стрелки» – в так называемую «вспомогательную армию», еще один североамериканский образец, в которой любому военнослужащему, независимо от послужного списка или опыта, могли быть присвоены любые звания с последующим назначением на любые должности. Таким образом, стало возможным и присвоение армейских званий даже иностранцам, таким как, к примеру, Джузеппе Гарибальди, или военно-морских офицерских званий, как звание адмирала, Жоре и Жорегиберри. И все же, несмотря на широкий охват, недостаток подходящих кандидатов на командные должности все еще ощущался. В подразделениях, частях и соединениях, сформированных ближе к концу войны, постоянно росло число нареканий по поводу бездеятельности, трусости и равнодушия полковых офицеров, что выражалось в падении дисциплины и некомпетентности штабов. Неаккуратное составление графиков маршей, сбои в работе администрации железных дорог, в войсковом подвозе – все это снижало боеспособность войск национальной обороны.
В национальной гвардии проблема офицерского состава являлась не только чисто командно-управленческой, но и политической. Полковые офицеры стационарной национальной гвардии, задачей которой в первую очередь являлась местная самооборона, по традиции избирались, и в декретах от 10 августа и 12 октября эта традиция была подтверждена. Офицеры мобильной гвардии, сил, предназначенных для участия в боевых действиях, назначались военным министерством, обычно по рекомендациям местных префектов, не всегда надежных в политическом отношении, и присутствие роялистов или верных императорским традициям, несогласных с событиями 4 сентября, растревожило наиболее уязвимые для пропаганды регионы, не говоря уже о самом Париже. Под давлением агитации парижан правительство 7 сентября распространило выборный принцип на офицерский состав и в мобильной гвардии. На незамедлительно последовавшую реакцию гражданских и военных властей в провинциях Гамбетта с оговоркой ответил: «В большинстве случаев мобильная гвардия подтверждает существующий выбор, и офицеры получают новые полномочия». Но он проявил избыточный оптимизм. Последовали жалобы от офицеров, лишившихся должностей по причине возраста или от тех, кто слишком долго прослужил рядовым солдатом, а также тех, кто справедливо возражал, что, дескать, их нельзя лишать званий и должностей без санкции на то военного совета. Делегация оставляла проведение выборов на усмотрение префектов. В большинстве департаментов они не проводились, а в Париже после трехмесячных мук, вызванных действиями никому не подконтрольной мобильной гвардии, правительство, наконец, набралось мужества и 18 декабря отменило выборный принцип в целом.