К этому времени командование сухопутной армией союзников принял спартанский царь Клеомброт, младший брат Леонида. Собрав на Пелопоннесе большое войско из нескольких десятков тысяч человек, он привел его на Истм. Вместе с лакедемонянами против персов выступили коринфяне, сикионцы, элейцы, воины из Аркадии, Трезена, Флиунта и Гермионы. Но многие полисы на полуострове предпочли самоустраниться от участия в боевых действиях: «
Оказавшись на Истме, Клеомброт развил бурную деятельность. Сначала по его приказу были перекрыты и сделаны непроезжими все дороги через перешеек, а затем царь распорядился возвести на Истме каменную стену от залива Коринфского до залива Саронического. Работы развернулись грандиозные, тысячи воинов приняли участие в строительстве, которое продолжалось и днем и ночью. В ход шло все, что можно было использовать при возведении стены; люди несли камни, кирпичи, набитые песком корзины. Спартанский царь искренне считал, что на море персов победить невозможно, и все свои надежды связывал с обороной Истмийского перешейка.
К этому времени Фокида было разорена полностью. Персы шли в горы и там вылавливали местных жителей, благо опыт подобных операций был у них отработан еще во время захвата островов Эгейского моря. Однако количество пленных было невелико: «
Пока персидские отряды обращали в дым и пепел Фокиду, главные силы Ксеркса вступили в Беотию. Беотийцы одни из первых признали власть персидского царя, но их очень тревожил тот факт, что отряд из Фив принимал участие в битве при Фермопилах. Слухи о том, что Ксеркс распорядился заклеймить сдавшихся в плен финских гоплитов во главе со стратегом, уже достигли Беотии. В этой тревожной обстановке беотийцы обратились к македонскому царю Александру, принимавшему участие в походе Ксеркса на Элладу. До конца не доверяя персам, они попросили царя ввести в города Беотии македонские гарнизоны, чтобы продемонстрировать свою лояльность Ахеменидам и одновременно избежать различных неприятных эксцессов. Александр считался верным союзником персов, и поэтому в глазах Ксеркса поведение беотийцев не должно было вызвать никаких подозрений. А для самих эллинов присутствие македонцев было более желательным, чем присутствие азиатов, людей другой культуры и с совершенно чуждым менталитетом.
Ксеркс сквозь пальцы посмотрел на такое поведение признавших его власть фиванцев и беотийцев, но на тех, кто посмел выступить против него с оружием в руках, царь обрушил свой карающий меч. Прежде всего это касалось города Феспии. Феспийские гоплиты героически сражались при Фермопилах и все до одного там полегли вместе со спартанцами царя Леонида. Этого персидский царь феспийцам простить не мог и приказал сжечь их город. Но местное население успело покинуть Феспии и убежать на Пелопоннес до того, как персидские войска подошли к городу.
Особый счет у Ахеменидов был к маленькому городку Платеи. В битве при Марафоне платейцы были единственными из эллинов, кто сражался плечом к плечу с афинянами против захватчиков. Во время нашествия Ксеркса жители Платей собрались идти служить в афинский флот гребцами и гоплитами, поскольку своих кораблей не имели. Спасая свои семьи от персов, платейцы задержались и прибыли в расположение афинян уже после битвы при Саламине. Но Ксеркс был очень хорошо осведомлен об антиперсидских настроениях платейцев, поэтому их город был предан огню и разрушен. Впрочем, большую роль в том, что Феспии и Платеи были уничтожены, сыграло подстрекательство фиванцев, которые руками персов расправлялись со своими недругами.
Рассказывая о пребывании Ксеркса в Беотии, Геродот делает примечательный вывод: «
Во время пребывания Ксеркса в Центральной Греции был организован поход персидского отряда на Дельфы, породивший немало вопросов, на которые невозможно дать точных ответов.