Эвакуация началась, афиняне отправляли семьи под защиту флота на острова Саламин и Эгину, а также в город Трезены, расположенный на восточном побережье Пелопоннеса. Трезены были выбраны неслучайно: согласно преданиям, дочь местного царя Питфея, Эфора, была матерью легендарного афинского героя Тезея. И теперь афиняне искали спасения на его родине. В Трезенах беглецов приняли со всем возможным радушием и по предложению уважаемого гражданина Никагора, издали постановление, где говорилось о том, что афиняне будут проживать в городе на общественный счет, получая по два обола в день. Детям было разрешено пользоваться садами и собирать в них плоды, а учителей для них также оплачивали из городской казны Трезены. В дальнейшем в память об этих событиях в городе была создана целая скульптурная композиция: «
Впрочем, среди афинян нашлись и такие, которые буквально восприняли изречение оракула о «деревянных стенах» и не согласились с той трактовкой, какую дал пророчеству Фемистокл. Эти люди поднялись на Акрополь и стали укреплять стены деревянным частоколом, надеясь, что с помощью этих укреплений они спасутся от персов. Создав в крепости большие запасы воды и продовольствия, афиняне завалили ворота бревнами, приготовившись к осаде. И никакие уговоры и увещания не могли заставить их покинуть город. Среди тех, кто заперся на Акрополе, было немало бедняков, не сумевших перебраться на Саламин из-за отсутствия средств (Herod. VIII, 51), а также стариков, оставленных по причине возраста (Plut. Them, 5). Отказались покидать святилища и хранители храмовой утвари.
Очень интересную информацию о том, как проходила эвакуация, приводит Аристотель. У него главная роль в происходящих событиях принадлежит Ареопагу: «
Плутарх пишет о том, что пополнению бюджета в немалой степени посодействовал Фемистокл. Когда с Акрополя уносили статую Афины, то со щита богини неожиданно пропала голова Горгоны, и стратег, используя эту пропажу как предлог, распорядился обыскивать имущество тех, кто покидал город. При этом было найдено большое количество денег, которое было изъято и направлено на нужды государства.
Фемистокл продолжал трудиться не покладая рук. Следующей его инициативой было принятие постановления о том, что все граждане, изгнанные из Афин остракизмом, могут вернуться и принять участие в борьбе с персами. Кроме тех, кто был обвинен в убийстве. С одной стороны, стратег хотел продемонстрировать афинянам необходимость объединения всех сил государства перед лицом внешней угрозы, а с другой стороны – просто опасался, что изгнанники могут примкнуть к Ксерксу. Ведь в свое время сын Писистрата Гипий убежал к Дарию, а затем вместе с персидской армией высадился у Марафона. Поэтому Фемистокл хотел исключить все неприятные неожиданности.
Когда эвакуация населения из города была закончена, афинские триеры присоединились к союзному флоту у Саламина.