Замминистра МГБ Гиги Угулава прямо назвал имя главного инициатора и организатора покушения на президента Михаила Саакашвили. Им якобы оказался глава МГБ Аджарии Иосиф Гогитидзе, который является братом покойной жены Абашидзе. Для большей убедительности МГБ через приближенную к власти телекомпанию «Рустави-2» показало оперативные кадры, на которых один из задержанных еще неделю назад, находившийся под следствием по подозрению в убийстве Эдуард Мсхаладзе подробно рассказал, что якобы был завербован спецслужбами автономии. В частности, Мсхаладзе поведал: «В мою камеру зашли министры госбезопасности и внутренних дел Аджарии и еще несколько человек. Они сказали, что освободят меня после того, как я выполню одно поручение. Я спросил, в чем оно состоит. Мне написали на бумаге фамилию Саакашвили». По словам замминистра, задержанный в Тбилиси Лери Беридзе в течение определенного времени изучал маршрут передвижения президента, а другие члены группы «отслеживали» поездки президента по Западной Грузии.
Более того, МГБ Грузии связывает взрыв цистерны с горючим и взрывами на железной дороге в Мцхета и Навтлуги, произошедшими в марте, с осложнением событий вокруг Аджарии. Спецслужбы полагают, что железная дорога выбрана диверсантами из Аджарии как стратегически важный объект с целью запугивания населения и осуществления террора властей.
В мае 2004 года Министерство госбезопасности Грузии предотвратило теракт на железнодорожном мосту. Согласно оперативной информации, сотрудники министерства госбезопасности обнаружили взрывное устройство, вмонтированное в железнодорожное полотно на Авчальском железнодорожном мосту. Мост, который находится в пригороде Тбилиси, соединяет восточные и западные направления железной дороги Грузии.