Основные силы английской авиации базировались в Сингапуре, а часть сил — на границе с Таиландом. Воды восточнее Сингапура усиленно патрулировались кораблями и авиацией. Началось воздушное патрулирование также в районах Кота-Бару и Куантана. На границе с Таиландом были развернуты крупные наземные силы, которые в районе Кота-Бару составляли 9 тыс. человек, а в провинции Кедах — около 20 тыс. человек.
Особенности погоды в Малайе оказывали большое влияние на ход разработанной Японией молниеносной операции. Малаккский п-ов, зажатый между Южно-Китайским морем и Бенгальским заливом, в основном не входит в зону зарождающихся в этих водах тайфунов. Однако полуостров в значительной степени находится под воздействием муссонов. В период с ноября по март здесь проходит северо-восточный муссон с сильными ветрами и ливневыми дождями. Волны на море достигают высоты 1,5–2 м, что делает почти невозможным высадку десанта. При выборе времени начала войны армейское и военно-морское командование, конечно, учитывало влияние погоды. Операция была рассчитана на то, чтобы захватить противника врасплох. В период северо-восточных муссонов здесь, в районе центральной горной системы, на восточном побережье выпадает большое количество осадков, в то время как на западном побережье стоит ясная погода. Эти погодные условия оказывали влияние на действия всех сил, особенно авиации, а главное, затрудняли противнику ведение воздушной разведки.
Для Малайской операции были привлечены от сухопутных войск 25-я армия и 3-е авиационное соединение, а от флота — малайское оперативное соединение; основу его составлял Южный экспедиционный флот, которому была придана 22-я воздушная флотилия.
В состав 25-й армии (командующий генерал-лейтенант Ямасита Томаюки, начальник штаба генерал-лейтенант Судзуки Сосаку) входили гвардейская дивизия, 5-я дивизия (командир генерал-лейтенант Мацуи Такуро) и 18-я дивизия (командир генерал-лейтенант Мацуи Ясуя). Армия была усилена 56-й дивизией (командир генерал-лейтенант Ватанабэ Масао), которая была сформирована к 27 ноября в собственно Японии, 5-я дивизия была специально подготовлена для ведения десантных действий и со времени китайского инцидента приобрела большой боевой опыт.
15 ноября генерал-лейтенант Ямасита прибыл в Сайгон. На основе приказа главнокомандующего Южной группы армий от 20 ноября был разработан оперативный план 25-й армии, содержание которого сводилось к следующему:
1. Армия с началом войны во взаимодействии с авиацией и флотом главными силами высаживается южнее перешейка Малаккского п-ова и, уничтожая английские войска, выдвигается на рубеж р. Перак; в дальнейшем, наращивая усилия, взаимодействуя с авиацией, выходит через Куала-Лумпур на рубеж Джохорского пролива и после подготовки захватывает Сингапур.
В это время одна группа войск высаживается на юго-восточном побережье Малайи с целью обеспечить продвижение главных сил.
2. В случае возникновения трудностей с высадкой первого эшелона, включающего главные силы армии, часть ее сил выдвигается в южный Таиланд и обеспечивает базирование авиации на передовых аэродромах, после чего высаживаются основные силы.
3. 5-я дивизия (главные силы армии) сосредоточивается в порту Санья, откуда в день Х — 4 выходит под прикрытием флота; на рассвете дня Х высаживается основными силами в Сингоре, а частью сил — в Патани, захватывает аэродромы, немедленно переходит государственную границу, уничтожает противостоящего противника, выходит на рубеж р. Перак и захватывает мостовые переправы.
4. Отряд Такуми (56-й пехотный полк 18-й дивизии под командованием командира 23-й пехотной бригады генерал-майора Такуми) сосредоточивается в порту Санья, откуда в день Х—4 выходит под прикрытием флота, высаживается на рассвете дня Х в Кота-Бару, уничтожает противостоящего противника и захватывает близлежащие аэродромы, в дальнейшем наступает в направлении Куала-Тренгану, Куантан с целью захвата аэродромов.
5. Гвардейская дивизия после выполнения в начале войны в составе 15-й армии своей задачи по несению гарнизонной службы в Таиланде последовательно перебрасывается по суше и морем на направление действия основных сил 25-й армии, сосредоточивается в тылу 5-й дивизии и в зависимости от обстановки следует за боевыми порядками 5-й дивизии или вводится в бой, пройдя через боевые порядки 5-й дивизии, не позднее примерно дня Х+15 сосредоточивает в тылу 5-й дивизии около трех пехотных батальонов.
6. 3-е авиационное соединение до дня Х — 3 развертывается в южной части Французского Индокитая; часть сил соединения выделяется для прикрытия транспортных судов; с началом войны во взаимодействии с морской авиацией наносит удары по аэродромам противника и прикрывает высадку главных сил армии; в дальнейшем подавляет авиацию противника, а частью сил взаимодействует с наземными войсками.
7. Силы второго эшелона десанта до дня Х+3 сосредоточиваются в бухте Кам-Рань; в день Х+8 высаживаются в Сингоре, Патани и Кота-Бару для усиления частей первого эшелона десанта.