Безумная политика притеснений православных королем Александром привела Литву к войне с Москвой (1500—1503), окончившейся в пользу Москвы, после чего Александр сделался снисходительнее к православным. Страх перед могущественным московским государем, явившимся защитником православных, заставил короля и поборников унии оставить на некоторое время попытки к насильственному ее насаждению в Литве и Западной Руси, и, таким образом, положение православных несколько облегчилось. Изменяя свою политику по отношению к православным, король Александр издал несколько грамот, ограждавших права Западно-Русской Церкви, из которых важнейшей была грамота, данная в подтверждение и ограждение судебных и имущественных прав всего православного духовенства, а также грамота о неприкосновенности святительского суда и церковного имущества. Изменившееся к лучшему положение Западно-Русской Церкви настолько подняло дух православных и укрепило их твердость в вере, что латинские писатели того времени с сокрушением отметили, что «с сего времени Русь снова поворотила к схизме; схизма вновь подняла свою голову и утвердилась в странах Великого Княжества Литовского и Польского» и что в схизму «открыто последовал не только низший класс народа, но и шляхта и вельможи, поколебавшиеся было прежде». К концу своего правления король Александр, по настоянию своего тестя московского государя Иоанна III, изменил свои отношения и к своей жене Елене Иоанновне. Он пожаловал ей несколько имений и г. Могилев, испросил у папы разрешение не принуждать ее к принятию римской веры, дозволить ей обновлять старые обители, строить церкви и обеспечивать их щедрыми вкладами. Его снисхождение к православным доходило даже до того, что он не запрещал и латинянам, перешедшим в православие, оставаться в нем, в чем можно убедиться из следующих слов данной им в 1503 г. грамоты г. Витебску: «Которые будут литвин або лях крещены у Витебску в русскую веру, а хто из того роду и тепере живет, того нам не рушити, права их хрестьянскаго ни в чом не ломати». Вот какое значение имела опека московских государей над православными западно-русами, проживавшими в Литовско-Польском государстве. Благодаря этой опеке православные хоть в конце правления короля Александра могли воспользоваться свободой исповедания своей веры.
Несмотря на все чинимые препятствия православным в исповедании их веры, литовско-русские князья и вельможи не только сохранили ее в правление Александра Казимировича в целости, но и для ее укрепления строили на своих землях монастыри и храмы [2]
. Особенно ревностным защитником православия в то время был новогрудский воевода и маршалок Александр Ходасевич. Его стараниями и жертвами был построен в 10 верстах от г. Белостока в 1500 г. Супрасльский монастырь, получивший с благословения Константинопольского Патриарха Иоакима в 1505 г. строгий общежительный устав и послуживший для всей православной Литвы образцом строгой монастырской жизни и уставных служб. В монастыре этом было собрано много церковных и святоотеческих книг, так что он стал и духовно-просветительным центром.Сигизмунд Казимирович (1506—1548)
Преемник Александра Сигизмунд Казимирович относился к православным вполне миролюбиво, и время его правления было временем наибольшего спокойствия и процветания Православной Церкви в княжестве Литовском. Спустя много лет после его смерти русский народ с благодарностью вспоминал о нем, как о покровителей фундаторе православных церквей. При его дворе весьма сильной и влиятельной была русская партия во главе с известным защитником православия князем Константином Ивановичем Острожским, заведовавшим военными силами Литвы. Начиная с «писарей» (статс-секретарей), Сигизмунд везде был окружен православными: посольствами заведовали Сапеги, личными финансами короля — Иван Солтан, государственными — Богуш-Боговитинов, на воеводствах Трокском, Витебском и Киевском сидели православные, главнейшие староства также были заняты православными.